253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1402 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  607  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  53.85 
 
 		 299 aa  325  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  48.62 
 
 		 291 aa  309  2.9999999999999997e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  41.58 
 
 		 314 aa  229  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  40.6 
 
 		 303 aa  225  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  37.16 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  30.3 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  30.11 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  28.26 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  30.83 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  27.82 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  28.24 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  25.94 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  27.51 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  27.34 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  28.21 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  25.89 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  27.14 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  26.98 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  26.82 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  28 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  28 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  24.91 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  26.48 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  25.37 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  27.03 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  31.94 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  24.9 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  27.1 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  25.88 
 
 		 243 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  25 
 
 		 271 aa  97.1  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  25 
 
 		 271 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  25 
 
 		 271 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  28.38 
 
 		 244 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  28.38 
 
 		 244 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  28.38 
 
 		 244 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  25.55 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  27.95 
 
 		 242 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  25.32 
 
 		 275 aa  92.4  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  28.63 
 
 		 286 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  25.19 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  23.05 
 
 		 317 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  26.87 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  23.05 
 
 		 317 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  26.84 
 
 		 218 aa  91.3  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  27.56 
 
 		 243 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  24.5 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  26.43 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  23.05 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  25.09 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  25.09 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  25.09 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  26.83 
 
 		 242 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  25.09 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  25.09 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  25.09 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  25.09 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  23.91 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  23.05 
 
 		 317 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  24.81 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  26.41 
 
 		 246 aa  89  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  27.63 
 
 		 246 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  27.27 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  24.89 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  25 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  24.21 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  26.99 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  26.97 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  25 
 
 		 272 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  25 
 
 		 272 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  25.22 
 
 		 242 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  25 
 
 		 272 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  23.99 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  26.56 
 
 		 288 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  24.6 
 
 		 272 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  25.31 
 
 		 289 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  25.1 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  30.24 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  22.64 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  22.74 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  24.63 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  22.96 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  25.65 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  25.6 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  21.99 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  22.02 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  24.83 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  23.89 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  23.29 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  26.32 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  26.72 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  24.63 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  26.83 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  29.19 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  24.28 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  29.69 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  25.21 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  25.86 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  32.17 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  25.31 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>