220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2161 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  553  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  82.22 
 
 
270 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  71.11 
 
 
271 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  68.15 
 
 
270 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  65.68 
 
 
271 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  65.68 
 
 
271 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  65.68 
 
 
271 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  67.53 
 
 
271 aa  364  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  62.73 
 
 
272 aa  353  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  62.73 
 
 
272 aa  353  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  62.73 
 
 
272 aa  353  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  62.73 
 
 
272 aa  353  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  62.73 
 
 
272 aa  353  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  62.36 
 
 
272 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  62.36 
 
 
272 aa  352  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  62.36 
 
 
272 aa  350  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  61.25 
 
 
272 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  61.25 
 
 
272 aa  342  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  61.25 
 
 
272 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  61.25 
 
 
272 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  61.25 
 
 
272 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  60.52 
 
 
272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  47 
 
 
288 aa  251  7e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  48.57 
 
 
289 aa  246  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  49.59 
 
 
277 aa  240  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  45.77 
 
 
313 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  45.82 
 
 
317 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  45.09 
 
 
317 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  45.93 
 
 
316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  45.09 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  45.09 
 
 
317 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  45.86 
 
 
301 aa  231  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  45.93 
 
 
316 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  45.19 
 
 
298 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  44.72 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  46.67 
 
 
317 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  46.95 
 
 
245 aa  208  9e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  40.66 
 
 
289 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  40.29 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  40.29 
 
 
289 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  40.37 
 
 
283 aa  195  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  40.88 
 
 
289 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  40.07 
 
 
289 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  41.48 
 
 
288 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  41.48 
 
 
288 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  40.59 
 
 
289 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  43.65 
 
 
284 aa  185  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  41.95 
 
 
287 aa  184  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  39.78 
 
 
292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  40.93 
 
 
280 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  38.4 
 
 
275 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  38.38 
 
 
275 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  39.63 
 
 
286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  37.7 
 
 
275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  35.86 
 
 
300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  38.6 
 
 
293 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  38.6 
 
 
293 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  35.56 
 
 
283 aa  165  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  36.47 
 
 
276 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  34.69 
 
 
287 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  38.13 
 
 
286 aa  158  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  39.53 
 
 
290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  35.77 
 
 
284 aa  145  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  35.56 
 
 
284 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  35.92 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  29.48 
 
 
271 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  27.3 
 
 
314 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  30.26 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  26.82 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  25.19 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  24.71 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  34.69 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  39.42 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  33.93 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  38.98 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  38.98 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  25.57 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  41.44 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  35 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  34.29 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  36.29 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  35.45 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  34 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  37.29 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9057  hypothetical protein  34 
 
 
221 aa  72  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  35.25 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  28.87 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  29.66 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  32.28 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  35.71 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  40.57 
 
 
303 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  35.88 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  36.36 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  33.09 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  33.09 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  35.43 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  30.71 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  33.57 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  34.35 
 
 
305 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  32.61 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>