235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2929 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
314 aa  649    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  50.17 
 
 
303 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  43.73 
 
 
299 aa  240  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  41.58 
 
 
293 aa  229  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  38.59 
 
 
308 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  39.26 
 
 
291 aa  209  6e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  33.82 
 
 
292 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  30.94 
 
 
283 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  31.65 
 
 
284 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  28.52 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  28.52 
 
 
293 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  31.73 
 
 
300 aa  126  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  28.4 
 
 
271 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  28.77 
 
 
290 aa  122  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  28.08 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  31.67 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  31.67 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  25.99 
 
 
289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  28.17 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  29.13 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  27.08 
 
 
286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  27.46 
 
 
288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  29.89 
 
 
277 aa  110  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  31.51 
 
 
251 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  31.23 
 
 
246 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  28.19 
 
 
272 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  27.8 
 
 
272 aa  105  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  28.19 
 
 
272 aa  105  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  29.13 
 
 
243 aa  105  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  28.19 
 
 
272 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  28.19 
 
 
272 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  28.19 
 
 
272 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  28.19 
 
 
272 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  26.05 
 
 
317 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  28.19 
 
 
272 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  26.05 
 
 
317 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  26.05 
 
 
317 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  27.31 
 
 
272 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  26.05 
 
 
317 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  27.3 
 
 
270 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  26.26 
 
 
289 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  26.22 
 
 
289 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  24.74 
 
 
289 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  27.8 
 
 
270 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  25.63 
 
 
287 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  25.35 
 
 
316 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  26.12 
 
 
271 aa  99.4  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  26.07 
 
 
249 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  24.83 
 
 
301 aa  99  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  25.56 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  23.83 
 
 
289 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  25.35 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  25.54 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  26.25 
 
 
272 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  26.25 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  26.25 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  24.82 
 
 
271 aa  96.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  26.25 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  26.64 
 
 
271 aa  96.3  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  26.25 
 
 
272 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  29.95 
 
 
245 aa  96.3  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  24.82 
 
 
271 aa  96.3  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  24.82 
 
 
271 aa  96.3  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  24.37 
 
 
275 aa  96.3  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  25.85 
 
 
280 aa  94  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  23.67 
 
 
283 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  29 
 
 
256 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  23.57 
 
 
275 aa  93.2  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  26.3 
 
 
313 aa  92.8  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  23.97 
 
 
298 aa  92  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  25.86 
 
 
242 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  27.27 
 
 
270 aa  90.1  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  28.57 
 
 
242 aa  90.1  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  23.05 
 
 
288 aa  89  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  31.82 
 
 
166 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  31.76 
 
 
246 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  27.95 
 
 
243 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  27.95 
 
 
247 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  28.07 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  28.7 
 
 
244 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  24.54 
 
 
289 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  27.47 
 
 
241 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  28.7 
 
 
244 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  28.7 
 
 
244 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  31.95 
 
 
244 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  24.6 
 
 
277 aa  87  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  24.36 
 
 
317 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  27.05 
 
 
293 aa  86.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  27.13 
 
 
240 aa  85.9  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  30.52 
 
 
279 aa  85.9  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  30.77 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  25.86 
 
 
246 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  28.42 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  26.64 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  25.26 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  37.16 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  22.03 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  27.78 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  23.47 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>