239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01726 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  578  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  46.95 
 
 		 300 aa  241  9e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  45.26 
 
 		 317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  44.89 
 
 		 317 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  46.44 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  44.53 
 
 		 317 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  45 
 
 		 316 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  44.23 
 
 		 316 aa  231  9e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  44.31 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  41.95 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  45.45 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  43.78 
 
 		 289 aa  228  7e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  41.97 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  46.54 
 
 		 317 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  45.45 
 
 		 301 aa  222  7e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  44.22 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  47.95 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  44.72 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  43.43 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  43.15 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  40.43 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  40.43 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  40.43 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  41.3 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  40.24 
 
 		 280 aa  198  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  40.16 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  40.16 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  40 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  40.16 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  40.16 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  40.16 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  39.75 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  39.75 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  41.2 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  39.92 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  40.73 
 
 		 289 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  40.24 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  38.96 
 
 		 275 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  39.75 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  39.75 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  39.75 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  39.75 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  39.75 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  38.31 
 
 		 284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  38.25 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  39.52 
 
 		 289 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  39.52 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  39.92 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  38.31 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  39.52 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  39.11 
 
 		 288 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  34.75 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  36.25 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  36.25 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  39.52 
 
 		 286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  35.06 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  35.86 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  33.47 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  33.47 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  36.47 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  35.2 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  30.94 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  35.57 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  32.02 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  34.55 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  26.34 
 
 		 271 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  29.89 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  26.32 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  26.48 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  29.34 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  30.17 
 
 		 243 aa  96.3  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  30.34 
 
 		 243 aa  95.9  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  26.54 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  25.1 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  27.16 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  26.54 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  26.81 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  25.98 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  32.34 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  28.87 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  34.42 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  30.21 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  25.83 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  30.95 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  32.37 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  32.54 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  36.96 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  25 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  36.92 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  36.81 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  32.3 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  31.82 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  36.92 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  34.09 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  26.13 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  24.56 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  36.92 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  25.31 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>