244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1114 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  95.85 
 
 		 289 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  95.5 
 
 		 289 aa  570  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  88.24 
 
 		 289 aa  524  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  70.98 
 
 		 287 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  68.86 
 
 		 289 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  72.18 
 
 		 286 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  70.18 
 
 		 288 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  67.72 
 
 		 289 aa  388  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  68.42 
 
 		 288 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  64.89 
 
 		 284 aa  351  8e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  44.37 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  43.8 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  44.91 
 
 		 277 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  39.32 
 
 		 298 aa  216  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  39.22 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  39 
 
 		 317 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  38.89 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  39.79 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  43.59 
 
 		 280 aa  209  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  38.56 
 
 		 317 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  40.83 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  40.43 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  39.08 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  38.81 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  39.43 
 
 		 301 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  40.66 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  40.29 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  40.29 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  40.29 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  40.29 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  40.29 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  40.29 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  39.18 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  40.35 
 
 		 271 aa  193  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  40.35 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  40.53 
 
 		 276 aa  192  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  40.35 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  39.93 
 
 		 272 aa  192  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  39.56 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  40.66 
 
 		 272 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  40.15 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  37.06 
 
 		 293 aa  185  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  41.45 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  39.39 
 
 		 275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  41.45 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  41.45 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  41.45 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  41.45 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  39.77 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  40.31 
 
 		 271 aa  182  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  39.92 
 
 		 277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  37.05 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  40.23 
 
 		 275 aa  178  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  38.16 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  34.4 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  35.66 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  41.15 
 
 		 245 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  38.46 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  34.69 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  37.73 
 
 		 271 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  37.2 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  37.36 
 
 		 270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  36.43 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  35.21 
 
 		 283 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  30.98 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  28 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  25.54 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  24.11 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  28.68 
 
 		 243 aa  93.2  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  25.19 
 
 		 252 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  26.91 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  32.24 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  24.28 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  25.75 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  32.43 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  26.67 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  26.85 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  31.71 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  31.93 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  29.71 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  31.79 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  33.11 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  27.82 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  27.82 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  27.82 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  29.57 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9057  hypothetical protein  33.11 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  34.21 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  29.25 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  32.46 
 
 		 242 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  34.51 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  24.44 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  30.64 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  33.57 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  35 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  33.64 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  36.79 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  32.17 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  26.98 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>