More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0487 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  489  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  51.05 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  55.08 
 
 		 245 aa  254  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  55.08 
 
 		 245 aa  254  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  46.64 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  45.61 
 
 		 243 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  47.08 
 
 		 249 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  40 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  44.17 
 
 		 243 aa  209  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  45.26 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  47.06 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  46.64 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  41.32 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  48.31 
 
 		 249 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  50 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  47.16 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  44.3 
 
 		 251 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  48.73 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  46.38 
 
 		 246 aa  195  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  38.66 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  44.49 
 
 		 256 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  41.6 
 
 		 241 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  47.46 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  47.84 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  43.1 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  44.59 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  39.51 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  43.53 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  44.49 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  37.5 
 
 		 244 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  44.49 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  37.5 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  40.37 
 
 		 282 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  40.91 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  43.22 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  42.02 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  41.42 
 
 		 244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  41.42 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  41.42 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  42.15 
 
 		 234 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  38.77 
 
 		 242 aa  171  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  36.88 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  37.97 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  37.08 
 
 		 242 aa  168  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  41.7 
 
 		 218 aa  168  8e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  36.6 
 
 		 251 aa  168  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  38.71 
 
 		 281 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  39.18 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  36.65 
 
 		 318 aa  164  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  36.24 
 
 		 305 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  36.01 
 
 		 350 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  36.4 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  42.32 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  37.11 
 
 		 322 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  36.77 
 
 		 336 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3016  hypothetical protein  47.26 
 
 		 242 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  34.97 
 
 		 305 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  35.42 
 
 		 308 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  36.94 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  36.63 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  38.17 
 
 		 313 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  35.84 
 
 		 340 aa  156  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  36.8 
 
 		 293 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  43.15 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  35.12 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  36.36 
 
 		 303 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  36.36 
 
 		 303 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  33.19 
 
 		 240 aa  151  7e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  36.36 
 
 		 303 aa  151  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  35.79 
 
 		 289 aa  151  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  35.96 
 
 		 321 aa  151  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  35.31 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  35.97 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  33.89 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  34.49 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  33.68 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  38.78 
 
 		 271 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  32.87 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  34.72 
 
 		 312 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  35.09 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  33.22 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  46.58 
 
 		 166 aa  138  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  36.3 
 
 		 296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  36.99 
 
 		 387 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  33.81 
 
 		 312 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  131  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  33.45 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  35.38 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 		 246 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  33.73 
 
 		 256 aa  128  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  29.27 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  35.45 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  34.26 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  34.39 
 
 		 264 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  32.4 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  32.91 
 
 		 264 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  32.73 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  34.56 
 
 		 265 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  31.34 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  34.3 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>