257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3289 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  78.8 
 
 		 283 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  75.27 
 
 		 275 aa  431  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  72 
 
 		 275 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  72.36 
 
 		 275 aa  401  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  70 
 
 		 276 aa  384  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  63.41 
 
 		 286 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  38.38 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  38.38 
 
 		 317 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  38.38 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  38.38 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  36.82 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  42.31 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  38.58 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  35.34 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  39.93 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  38.35 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  39.05 
 
 		 288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  37 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  39.06 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  37.41 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  35.66 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  34.98 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  34.44 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  36.8 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  34.44 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  34.44 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  34.44 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  34.44 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  34.44 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  34.44 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  37.97 
 
 		 317 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  34.07 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  37.69 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  37.82 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  36.25 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  35.08 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  35.97 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  37.81 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  35.18 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  34.42 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  34.42 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  34.42 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  34.42 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  35.56 
 
 		 270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  36.43 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  38.12 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  33.58 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  34.06 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  35.32 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  34.94 
 
 		 289 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  35.42 
 
 		 313 aa  158  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  36.3 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  35.08 
 
 		 272 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  32.96 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  32.96 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  32.96 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  32.81 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  32.87 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  30.18 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  32.05 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  32.28 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  26.83 
 
 		 287 aa  118  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  28.01 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  30.9 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  38.27 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  24.91 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  38.96 
 
 		 243 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  38.1 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  38.36 
 
 		 241 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  37.41 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  34.69 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  38.1 
 
 		 246 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  30.71 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  31.29 
 
 		 240 aa  91.3  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  32.65 
 
 		 242 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  25.65 
 
 		 237 aa  89.7  5e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  25.39 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  32.43 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  28.21 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  24.1 
 
 		 303 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  31.54 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  39.04 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  41.89 
 
 		 249 aa  86.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  30.41 
 
 		 244 aa  85.5  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  29.17 
 
 		 242 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  36.55 
 
 		 166 aa  85.1  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3871  hypothetical protein  42.42 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  32.76 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  32.76 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  42.97 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  32.65 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  29.48 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  23.87 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  30.28 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  31.13 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  35.76 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  22.73 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>