288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3084 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  593  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  84.64 
 
 		 293 aa  519  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  58.33 
 
 		 284 aa  298  7e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  50.69 
 
 		 284 aa  289  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  50.69 
 
 		 290 aa  265  5.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  46.32 
 
 		 283 aa  258  9e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  43.35 
 
 		 284 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  38.81 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  42.7 
 
 		 292 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  41.64 
 
 		 280 aa  201  9e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  38.81 
 
 		 289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  40.21 
 
 		 286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  39.58 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  39.18 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  38.81 
 
 		 287 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  37.88 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  37.06 
 
 		 289 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  37.06 
 
 		 289 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  37.06 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  36.27 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  33.92 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  34.41 
 
 		 277 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  36.14 
 
 		 317 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  36.14 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  36.14 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  35.51 
 
 		 317 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  35.34 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  31.97 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  33.87 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  35.34 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  38.6 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  36.47 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  34.77 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  34.77 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  34.77 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  34.77 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  34.77 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  34.77 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  33.47 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  34.77 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  33.46 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  36.49 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  34.41 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  36.49 
 
 		 271 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  36.49 
 
 		 271 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  35.27 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  35.27 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  34.69 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  35.43 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  35.27 
 
 		 272 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  35.27 
 
 		 272 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  35.27 
 
 		 272 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  38.97 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  36.84 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  34.22 
 
 		 271 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  36.9 
 
 		 271 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  35.79 
 
 		 270 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  32.76 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  33.94 
 
 		 283 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  34.88 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  35.31 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  28.73 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  34.2 
 
 		 275 aa  135  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  30.3 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  28.52 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  32.09 
 
 		 271 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  32.05 
 
 		 283 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  33.21 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  33.46 
 
 		 286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  31.5 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  33.71 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  26.69 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  25.91 
 
 		 252 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  28.4 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  28.4 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  29.02 
 
 		 264 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  36.9 
 
 		 249 aa  94  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  27.53 
 
 		 256 aa  93.6  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  29.63 
 
 		 237 aa  92  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  28.4 
 
 		 243 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  30.63 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  29.21 
 
 		 242 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  30.36 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  89.4  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  24.59 
 
 		 251 aa  89.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  32.7 
 
 		 248 aa  89  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  26.95 
 
 		 256 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  30.67 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  36.53 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  34.76 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  37.34 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  35.58 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  32.8 
 
 		 244 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  34.62 
 
 		 244 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  35.44 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  24.54 
 
 		 256 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  26.91 
 
 		 261 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  28.51 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  28.57 
 
 		 276 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>