264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10243 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  605  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  53.31 
 
 		 299 aa  315  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  48.62 
 
 		 293 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  39.26 
 
 		 314 aa  209  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  37.09 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  36.12 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  31.02 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  26.69 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  29.08 
 
 		 245 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  29.08 
 
 		 245 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  28.91 
 
 		 284 aa  99.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  27.47 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  27.17 
 
 		 293 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  26.54 
 
 		 277 aa  95.9  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  27.34 
 
 		 316 aa  95.5  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  29.02 
 
 		 218 aa  95.1  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  25.47 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  28.16 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  32.58 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  26.81 
 
 		 283 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  26.99 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  27.75 
 
 		 244 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  27.75 
 
 		 244 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  26.67 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  27.75 
 
 		 244 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  27.21 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  27.14 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  27.14 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  26.01 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  27.14 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  25.97 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  28.34 
 
 		 242 aa  89.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  29.25 
 
 		 284 aa  89  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  25.86 
 
 		 264 aa  89  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  27.13 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  26.32 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  27.13 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  25.39 
 
 		 283 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  25.3 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  33.71 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  31.64 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  27.34 
 
 		 312 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  24.9 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  25.68 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  32.49 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  25.96 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  30.41 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  26.4 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  26.05 
 
 		 247 aa  87  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  26.34 
 
 		 271 aa  86.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  27.08 
 
 		 246 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  25.96 
 
 		 317 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  28.57 
 
 		 247 aa  86.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  26.52 
 
 		 242 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  25.35 
 
 		 317 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  25.09 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  33.53 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  27.63 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  30.77 
 
 		 244 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  25.44 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  26.43 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  29.67 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  26.96 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  27.38 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  25.86 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  26.07 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  28 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  27.13 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  23.53 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  34.93 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  28.05 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  26.91 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  26.12 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  27.59 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  24.8 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  25.35 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  33.67 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  28.42 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  26.99 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  26.12 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  28.04 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  24.8 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  31.25 
 
 		 254 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  24.11 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  25.93 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  25.75 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  25.36 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  30.65 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  25.99 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  25.99 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  25.99 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  25.99 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  25.99 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  25.99 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  25.99 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  25.83 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  28.46 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  27.56 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  27.1 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  27.24 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>