291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2494 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  94.1 
 
 		 350 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  80.33 
 
 		 305 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  64.55 
 
 		 312 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  64.88 
 
 		 312 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  64.81 
 
 		 295 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  60.6 
 
 		 308 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  60.98 
 
 		 286 aa  358  5e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  59.52 
 
 		 321 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  53.77 
 
 		 340 aa  332  6e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  55.86 
 
 		 325 aa  322  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  55.63 
 
 		 303 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  54.95 
 
 		 318 aa  320  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  56.99 
 
 		 289 aa  318  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  54.55 
 
 		 301 aa  314  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  54.2 
 
 		 303 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  53.77 
 
 		 308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  53.36 
 
 		 336 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  53.79 
 
 		 322 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  54.55 
 
 		 303 aa  291  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  52.1 
 
 		 296 aa  291  8e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  54.78 
 
 		 293 aa  289  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  49.48 
 
 		 281 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  50.69 
 
 		 282 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  52.94 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  52.94 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  52.94 
 
 		 303 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  48.97 
 
 		 313 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  47.42 
 
 		 277 aa  264  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  47.69 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  47.6 
 
 		 281 aa  250  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  42.66 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  42.51 
 
 		 272 aa  225  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  43.26 
 
 		 267 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  42.61 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  40.91 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  41.11 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  40.42 
 
 		 274 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  40.21 
 
 		 316 aa  218  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  41.4 
 
 		 268 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  41.2 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  41.75 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  41.75 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  40.07 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  41.75 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  41.55 
 
 		 263 aa  211  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  40.35 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  39.3 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  40 
 
 		 309 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  35.92 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  39.79 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  39.44 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  39.65 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  40.44 
 
 		 290 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  38.95 
 
 		 259 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  37.68 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  40.15 
 
 		 259 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  40.15 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  37.68 
 
 		 248 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  37.98 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  38.16 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  36.84 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  38.11 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  38.85 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  36.59 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  35.66 
 
 		 242 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  34.6 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  34.6 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  36.4 
 
 		 241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  34.02 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  34.29 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  33.68 
 
 		 243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  31.69 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  33.81 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  37.96 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  32.27 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  32.52 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  31.36 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  31.83 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  34.15 
 
 		 242 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  32.87 
 
 		 243 aa  136  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  34.04 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  30.85 
 
 		 242 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  33.1 
 
 		 246 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  33.21 
 
 		 261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  32.06 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  29.1 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  31.94 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  31.94 
 
 		 244 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  31.94 
 
 		 244 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  32.06 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  30.28 
 
 		 241 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  32.04 
 
 		 251 aa  122  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  32.37 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  34.76 
 
 		 218 aa  121  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  29.57 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04829  DUF72  35.11 
 
 		 203 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  28.17 
 
 		 251 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  32.62 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  31.21 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>