276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4684 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
273 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  91.76 
 
 
279 aa  494  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  66.17 
 
 
272 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  67.95 
 
 
264 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  65 
 
 
263 aa  361  8e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  62.02 
 
 
268 aa  327  9e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  60.23 
 
 
268 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  59.07 
 
 
309 aa  323  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  60.62 
 
 
267 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  59.3 
 
 
259 aa  322  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  59.54 
 
 
267 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  60.24 
 
 
259 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  59.84 
 
 
269 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  58.17 
 
 
267 aa  313  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  54.58 
 
 
274 aa  311  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  56.06 
 
 
267 aa  310  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  56.11 
 
 
316 aa  309  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  58.24 
 
 
264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  56.4 
 
 
290 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  54.23 
 
 
282 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  55.47 
 
 
268 aa  291  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  55.64 
 
 
268 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  54.72 
 
 
268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  55.56 
 
 
265 aa  285  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  53.26 
 
 
267 aa  285  8e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  53.26 
 
 
265 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  49.43 
 
 
254 aa  271  7e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  49.06 
 
 
259 aa  271  9e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  52.11 
 
 
261 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  51.54 
 
 
248 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  48.11 
 
 
267 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  46.53 
 
 
301 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  50.19 
 
 
252 aa  250  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  43.1 
 
 
303 aa  244  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  43.75 
 
 
303 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  43.79 
 
 
312 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  42.66 
 
 
305 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  43.55 
 
 
308 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  44.17 
 
 
293 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  43.06 
 
 
295 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  42.91 
 
 
340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  42.16 
 
 
318 aa  232  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  42.66 
 
 
305 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  42.31 
 
 
350 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  43.84 
 
 
312 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  42.86 
 
 
325 aa  221  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  39.65 
 
 
286 aa  221  8e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  41.4 
 
 
289 aa  217  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  41.81 
 
 
322 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  41.46 
 
 
336 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  42.47 
 
 
303 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  42.47 
 
 
303 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  42.47 
 
 
303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  41.75 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  42.11 
 
 
303 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  42.25 
 
 
296 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  39.93 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  40.7 
 
 
277 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  37.54 
 
 
282 aa  192  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  36.49 
 
 
313 aa  192  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  37.73 
 
 
288 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  43.66 
 
 
270 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  36.43 
 
 
281 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  35.42 
 
 
281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  40.09 
 
 
254 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04829  DUF72  41.79 
 
 
203 aa  149  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  34.55 
 
 
256 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  34.45 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  32.86 
 
 
244 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  33.01 
 
 
245 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  33.01 
 
 
245 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  32.77 
 
 
264 aa  121  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  33.98 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  34.62 
 
 
242 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  34.4 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  32.08 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  30.48 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  30.95 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  33.91 
 
 
271 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  31.34 
 
 
242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  34.29 
 
 
246 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  30.23 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  31.67 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  29.65 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  30.09 
 
 
251 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  106  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  33.66 
 
 
249 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  31.54 
 
 
279 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  35.42 
 
 
247 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  32.72 
 
 
249 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  29.82 
 
 
243 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  29.73 
 
 
247 aa  99  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  32.72 
 
 
249 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  32.06 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  27.31 
 
 
242 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  26.73 
 
 
236 aa  96.3  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  29.7 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  30.48 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  34.9 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>