257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4651 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  617  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  68.29 
 
 
289 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  62.72 
 
 
336 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  62.72 
 
 
322 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  62.02 
 
 
325 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  60.49 
 
 
308 aa  359  4e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  59.79 
 
 
303 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  59.79 
 
 
303 aa  348  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  59.79 
 
 
303 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  57.69 
 
 
308 aa  324  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  55.59 
 
 
301 aa  317  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  53.72 
 
 
321 aa  316  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  55.59 
 
 
305 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  53.26 
 
 
303 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  54.64 
 
 
295 aa  308  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  55.94 
 
 
350 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  54.55 
 
 
305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  53.85 
 
 
286 aa  301  7.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  52.61 
 
 
303 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  50.49 
 
 
312 aa  298  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  52.43 
 
 
318 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  50.49 
 
 
312 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  55.21 
 
 
296 aa  287  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  50.71 
 
 
340 aa  285  7e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  52.9 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  52.84 
 
 
277 aa  279  5e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  50.71 
 
 
313 aa  275  9e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  47.59 
 
 
282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  47.8 
 
 
281 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  46.69 
 
 
288 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  43.9 
 
 
264 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  42.55 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  43.05 
 
 
281 aa  216  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  42.11 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  41.4 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  42.11 
 
 
267 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  41.11 
 
 
265 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  41.75 
 
 
268 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  41.4 
 
 
274 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  43.16 
 
 
279 aa  208  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  42.81 
 
 
268 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  39.65 
 
 
263 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  38.6 
 
 
267 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  41.75 
 
 
264 aa  202  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  38.01 
 
 
316 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  36.93 
 
 
267 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  38.52 
 
 
268 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  41.4 
 
 
254 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  38.6 
 
 
267 aa  192  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  40.36 
 
 
269 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  40 
 
 
259 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  38.6 
 
 
309 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  38.46 
 
 
267 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  38.46 
 
 
282 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  40 
 
 
259 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  37.81 
 
 
268 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  39.72 
 
 
254 aa  182  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  38.95 
 
 
261 aa  178  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  37.5 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  38.25 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  35.44 
 
 
268 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  36.93 
 
 
248 aa  169  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  35.66 
 
 
265 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  34.38 
 
 
252 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  32.06 
 
 
243 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  33.57 
 
 
256 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  32.75 
 
 
251 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  35.09 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  34.64 
 
 
245 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  34.64 
 
 
245 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  34.52 
 
 
249 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  31.02 
 
 
247 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  36.36 
 
 
270 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  31.8 
 
 
244 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  35.69 
 
 
241 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  31.67 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  35.4 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  31.58 
 
 
252 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  33.56 
 
 
249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  32.75 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  34.49 
 
 
243 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  31.65 
 
 
264 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  33.68 
 
 
244 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  33.68 
 
 
244 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  33.68 
 
 
244 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  30.34 
 
 
241 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 
249 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  32.55 
 
 
249 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  32.26 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  31.01 
 
 
242 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 
240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  32.06 
 
 
246 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 
279 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  29.31 
 
 
242 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  30.04 
 
 
246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  26.06 
 
 
237 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  30.85 
 
 
243 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  26.86 
 
 
240 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  28.38 
 
 
254 aa  106  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  31.21 
 
 
247 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>