248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0014 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  74.39 
 
 		 309 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  63.24 
 
 		 290 aa  338  5.9999999999999996e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  60.37 
 
 		 261 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  57.2 
 
 		 265 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  56.11 
 
 		 273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  53.51 
 
 		 274 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  53.99 
 
 		 272 aa  305  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  56.27 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  54.37 
 
 		 267 aa  297  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  54.75 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  54.02 
 
 		 279 aa  295  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  53.64 
 
 		 259 aa  295  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  53.96 
 
 		 264 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  53.38 
 
 		 267 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  53.26 
 
 		 254 aa  293  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  53.79 
 
 		 282 aa  291  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  52.65 
 
 		 267 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  51.89 
 
 		 268 aa  287  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  53.18 
 
 		 263 aa  286  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  52.45 
 
 		 268 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  50.95 
 
 		 268 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  53.26 
 
 		 248 aa  279  4e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  50.19 
 
 		 268 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  46.59 
 
 		 267 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  52.17 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  53.25 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  48.66 
 
 		 265 aa  263  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  50.19 
 
 		 259 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  46.97 
 
 		 267 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  50 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  45.58 
 
 		 293 aa  235  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  41.03 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  39.51 
 
 		 305 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  41.24 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  38.54 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  39.02 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  39.93 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  39.16 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  39.93 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  40.21 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  45.45 
 
 		 252 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  39.6 
 
 		 322 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  39.86 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  38.46 
 
 		 295 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  40.27 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  40.77 
 
 		 289 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  39.01 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  39 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  38.81 
 
 		 312 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  39 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  39 
 
 		 303 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  38.41 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  38.11 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  41.05 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  36.82 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  38.01 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04829  DUF72  49.5 
 
 		 203 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  37.28 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  35.96 
 
 		 281 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  34.23 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  33.8 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  37.5 
 
 		 270 aa  162  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  36.17 
 
 		 288 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  34.16 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  41.4 
 
 		 254 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  31.6 
 
 		 256 aa  136  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  34.26 
 
 		 242 aa  126  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  34.1 
 
 		 271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  34.86 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  34.86 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  29.8 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  30.35 
 
 		 243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  33.17 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  28.9 
 
 		 252 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  27.76 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  29.58 
 
 		 251 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  29.95 
 
 		 246 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  34.22 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  27.38 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  32.33 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  31.65 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  30.13 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  28.17 
 
 		 247 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  28.97 
 
 		 244 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  33.69 
 
 		 246 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  28.5 
 
 		 244 aa  99.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  32.79 
 
 		 244 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  31.46 
 
 		 243 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  29.95 
 
 		 242 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  29.52 
 
 		 243 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  32.88 
 
 		 259 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  27.59 
 
 		 242 aa  95.9  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  29.3 
 
 		 242 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  28.19 
 
 		 251 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  30.53 
 
 		 218 aa  94  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  28.97 
 
 		 246 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  29.3 
 
 		 240 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  25.29 
 
 		 251 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 		 166 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>