277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1644 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  79.39 
 
 		 267 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  78.24 
 
 		 267 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  77.69 
 
 		 274 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  78.63 
 
 		 267 aa  425  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  77.19 
 
 		 268 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  75.67 
 
 		 267 aa  418  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  63.32 
 
 		 268 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  62.45 
 
 		 268 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  61.6 
 
 		 263 aa  331  7.000000000000001e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  58.56 
 
 		 267 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  57.41 
 
 		 268 aa  323  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  60.92 
 
 		 264 aa  318  5e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  59.16 
 
 		 272 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  58.24 
 
 		 273 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  57.95 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  57.69 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  56.27 
 
 		 316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  55.3 
 
 		 267 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  54.05 
 
 		 309 aa  299  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  53.23 
 
 		 282 aa  295  5e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  56.7 
 
 		 265 aa  295  6e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  56.15 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  58.23 
 
 		 269 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  57.83 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  54.47 
 
 		 290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  54.62 
 
 		 248 aa  285  7e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  48.77 
 
 		 301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  53.46 
 
 		 259 aa  271  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  52.85 
 
 		 268 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  49.81 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  49.42 
 
 		 259 aa  265  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  45.3 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  45.96 
 
 		 318 aa  251  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  48.33 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  44.96 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  43.21 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  46.5 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  48.08 
 
 		 296 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  40.7 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  42.25 
 
 		 308 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  42.96 
 
 		 312 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  44.37 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  41.96 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  43.48 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  38.81 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  41.44 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  40.91 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  42.07 
 
 		 325 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  40 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  42.91 
 
 		 277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  41.72 
 
 		 303 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  41.72 
 
 		 303 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  43.21 
 
 		 303 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  41.72 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  40.28 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  40.28 
 
 		 322 aa  208  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  39.24 
 
 		 308 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  40.69 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  36.65 
 
 		 313 aa  194  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  39.11 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  36.33 
 
 		 281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04829  DUF72  46.53 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  41.54 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  43.46 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  35.49 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  31.03 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  34.56 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  32.44 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  33.86 
 
 		 264 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  38.91 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  33.8 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  30.77 
 
 		 241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  34.39 
 
 		 242 aa  125  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  34.43 
 
 		 245 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  34.43 
 
 		 245 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  30.65 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  30.59 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  32.11 
 
 		 242 aa  122  8e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  31.89 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  30.37 
 
 		 244 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  31.03 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  28.97 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  29.89 
 
 		 244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  32.57 
 
 		 244 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  32.57 
 
 		 244 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  29.41 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  35.85 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  32.57 
 
 		 244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  30.32 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  30.63 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  33.79 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  31.51 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  34.95 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  34.55 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  28.85 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  32.13 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  29.96 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  34.09 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  34.09 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>