256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1924 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
268 aa  553  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  94.03 
 
 
268 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  66.79 
 
 
267 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  67.42 
 
 
267 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  65.67 
 
 
268 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  64.37 
 
 
267 aa  349  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  64.37 
 
 
267 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  63.46 
 
 
267 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  64.23 
 
 
267 aa  345  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  62.84 
 
 
268 aa  341  9e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  63.22 
 
 
274 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  63.32 
 
 
264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  56.44 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  55.77 
 
 
263 aa  298  4e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  56.2 
 
 
265 aa  294  9e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  55 
 
 
309 aa  292  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  55.47 
 
 
273 aa  291  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  53.03 
 
 
265 aa  288  9e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  55.56 
 
 
272 aa  285  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  55.06 
 
 
290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  50.95 
 
 
316 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  53.26 
 
 
279 aa  275  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  49.43 
 
 
282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  50.57 
 
 
254 aa  271  7e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  50.96 
 
 
259 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  54.4 
 
 
269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  54.4 
 
 
259 aa  268  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  49.63 
 
 
261 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  51.95 
 
 
259 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  49.81 
 
 
248 aa  257  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  50.75 
 
 
268 aa  255  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  43.21 
 
 
301 aa  245  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  48.52 
 
 
252 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  41.52 
 
 
293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  39.31 
 
 
318 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  39.18 
 
 
303 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  37.37 
 
 
303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  40.69 
 
 
312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  38.46 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  38.71 
 
 
340 aa  213  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  38.93 
 
 
305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  39.65 
 
 
308 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  40 
 
 
350 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  39.3 
 
 
305 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  37.85 
 
 
321 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  38.52 
 
 
312 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  38.87 
 
 
286 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  39.12 
 
 
303 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  39.12 
 
 
303 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  39.12 
 
 
303 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  38.97 
 
 
325 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  37.76 
 
 
289 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  36.99 
 
 
322 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  38.6 
 
 
288 aa  185  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  41.89 
 
 
270 aa  184  9e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  36.9 
 
 
336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  36.52 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  37.81 
 
 
303 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  35.15 
 
 
281 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  37.28 
 
 
296 aa  176  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  36.3 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  32.85 
 
 
313 aa  165  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  33.1 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  42.25 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  32.06 
 
 
282 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04829  DUF72  40.59 
 
 
203 aa  153  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  30.53 
 
 
256 aa  136  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  32.61 
 
 
264 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  30.91 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  31.67 
 
 
251 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  28.52 
 
 
242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  31.06 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  28.08 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  28.79 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  31.75 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  31.75 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  30.7 
 
 
249 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  36.7 
 
 
244 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  29.17 
 
 
241 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  29.81 
 
 
242 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  36.7 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  32.55 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  30.04 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  29.17 
 
 
242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  30.97 
 
 
254 aa  112  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  31.15 
 
 
240 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  35.11 
 
 
244 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  31.19 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  29.69 
 
 
271 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  33.13 
 
 
218 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  28.52 
 
 
241 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  26.85 
 
 
251 aa  105  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  29.15 
 
 
254 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  29.03 
 
 
244 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  33.18 
 
 
279 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  31.31 
 
 
261 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  29.13 
 
 
242 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  27.57 
 
 
247 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  37.41 
 
 
166 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  28.95 
 
 
246 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>