279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0366 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
252 aa  525  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  51.24 
 
 
246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  37.92 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  41.32 
 
 
242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  40.55 
 
 
256 aa  196  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  39.27 
 
 
249 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  37.29 
 
 
243 aa  185  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  38.68 
 
 
251 aa  184  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  39.18 
 
 
249 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  38.78 
 
 
249 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  38.21 
 
 
249 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  35.42 
 
 
237 aa  167  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  35.45 
 
 
282 aa  162  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  36.89 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  36.89 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  36.25 
 
 
240 aa  162  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  36.89 
 
 
244 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  34.82 
 
 
242 aa  158  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  33.88 
 
 
245 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  33.88 
 
 
245 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  35 
 
 
242 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 
241 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  31.64 
 
 
313 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  34.46 
 
 
281 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  33.61 
 
 
244 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  31.74 
 
 
318 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  34.29 
 
 
303 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  32.27 
 
 
243 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  34.84 
 
 
246 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  32.77 
 
 
244 aa  152  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  32.06 
 
 
305 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  36.91 
 
 
256 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  31.95 
 
 
293 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  30.86 
 
 
242 aa  148  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  35.83 
 
 
243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  35.22 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  33.6 
 
 
271 aa  146  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  31.37 
 
 
340 aa  146  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  31.75 
 
 
293 aa  145  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  34.05 
 
 
264 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  29.72 
 
 
301 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  31.71 
 
 
350 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  36.25 
 
 
279 aa  145  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  32.08 
 
 
251 aa  144  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  31.47 
 
 
312 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  35.44 
 
 
247 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  32.75 
 
 
289 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  31.95 
 
 
261 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  32.92 
 
 
241 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  31.53 
 
 
308 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  32.38 
 
 
286 aa  141  8e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  33.88 
 
 
241 aa  141  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  31.36 
 
 
305 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  30.38 
 
 
312 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  31.95 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  30.74 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  31.65 
 
 
336 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  31.8 
 
 
303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  34.56 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  32.58 
 
 
277 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  33.91 
 
 
261 aa  138  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  31.65 
 
 
322 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  30.03 
 
 
325 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  34.71 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  31.06 
 
 
321 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  29.47 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  31.88 
 
 
281 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  28.14 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  28.23 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  32.26 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  28.23 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  32.23 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  31.58 
 
 
303 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  32.5 
 
 
245 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  31.6 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  32.08 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  33.06 
 
 
254 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  31.83 
 
 
296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  31.67 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  31.56 
 
 
256 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  31.34 
 
 
272 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  31.95 
 
 
244 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  31.8 
 
 
244 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  30.91 
 
 
268 aa  121  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  31.02 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  29.55 
 
 
268 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  30.56 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  29.03 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  31.38 
 
 
246 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  31.02 
 
 
267 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  30.41 
 
 
267 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  32.72 
 
 
264 aa  119  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  30.51 
 
 
288 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  29.59 
 
 
267 aa  118  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  30.73 
 
 
267 aa  118  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  39.6 
 
 
166 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  28.63 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  31.73 
 
 
243 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  30.58 
 
 
248 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1295  hypothetical protein  30.8 
 
 
261 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>