299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3451 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  519  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  47.3 
 
 
242 aa  237  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  47.01 
 
 
247 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  44.21 
 
 
246 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  44.44 
 
 
244 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  44.02 
 
 
244 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3016  hypothetical protein  46.58 
 
 
242 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628542  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  33.89 
 
 
242 aa  149  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  33.73 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  37.93 
 
 
241 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  33.2 
 
 
247 aa  138  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  34.71 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  38.43 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  32.92 
 
 
243 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  30.67 
 
 
240 aa  128  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  32.59 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  32.33 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  32.44 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  33.76 
 
 
264 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  33.2 
 
 
271 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  32.35 
 
 
245 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0312  hypothetical protein  78.48 
 
 
103 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.835667  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  32.35 
 
 
245 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  32.91 
 
 
251 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  32.92 
 
 
312 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  29.35 
 
 
312 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  30.13 
 
 
237 aa  122  7e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  31.49 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  30.32 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  34.05 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  32.16 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  37.58 
 
 
244 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  30.77 
 
 
242 aa  115  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  30.86 
 
 
249 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  32.92 
 
 
248 aa  115  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  33.19 
 
 
280 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  28.77 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  36.61 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  28.57 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  30.94 
 
 
313 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  31.78 
 
 
244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  31.44 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  30.96 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  30.89 
 
 
286 aa  112  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  34.97 
 
 
249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  34.68 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  29.96 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  34.16 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  31.02 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  29.45 
 
 
282 aa  108  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  34.97 
 
 
249 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  30.6 
 
 
247 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  29.1 
 
 
241 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  27.88 
 
 
248 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  28.82 
 
 
242 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  30.2 
 
 
259 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  28.28 
 
 
246 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  27.87 
 
 
241 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  30.4 
 
 
261 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  27.56 
 
 
236 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  34 
 
 
254 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  31.39 
 
 
234 aa  102  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  37.06 
 
 
292 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  27.5 
 
 
293 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  30.38 
 
 
295 aa  102  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  26.3 
 
 
336 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  27.9 
 
 
277 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  28.09 
 
 
268 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  30.04 
 
 
283 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  28.63 
 
 
268 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  28.72 
 
 
318 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  25.95 
 
 
322 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  26.8 
 
 
350 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  27.4 
 
 
305 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  28.04 
 
 
282 aa  99  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  27.99 
 
 
281 aa  98.6  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  32.87 
 
 
265 aa  98.6  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  26.48 
 
 
308 aa  98.6  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  27.65 
 
 
264 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  32.86 
 
 
289 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  26.51 
 
 
303 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  27.86 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  30.41 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  32.73 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  29.18 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  26.16 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  28.83 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0720  hypothetical protein  27.73 
 
 
255 aa  97.1  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  25.61 
 
 
305 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  29.67 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  34.55 
 
 
259 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  31.92 
 
 
270 aa  96.7  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  32.73 
 
 
269 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  28.69 
 
 
303 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  25.61 
 
 
325 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  26.17 
 
 
303 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  26.17 
 
 
303 aa  95.9  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  31.58 
 
 
268 aa  95.5  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  30.69 
 
 
279 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1160  hypothetical protein  26.34 
 
 
261 aa  95.1  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0500427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>