More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1212 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  100 
 
 		 243 aa  499  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  51.46 
 
 		 249 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  44.49 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  46.15 
 
 		 256 aa  211  5.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  48.94 
 
 		 249 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  49.36 
 
 		 249 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  44.17 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  48.94 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  43.7 
 
 		 244 aa  199  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  39.33 
 
 		 247 aa  197  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  43.83 
 
 		 244 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  40.25 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  42.15 
 
 		 245 aa  189  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  42.15 
 
 		 245 aa  189  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  45.15 
 
 		 242 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  44.81 
 
 		 241 aa  188  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  43.46 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  37.29 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  42.56 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  43.1 
 
 		 243 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  42.67 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  43.7 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  45.42 
 
 		 240 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  41 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  35.68 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  43.46 
 
 		 246 aa  174  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  38.66 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  43.61 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  45.18 
 
 		 256 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  38.91 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  42.86 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  42.86 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  42.86 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  41.77 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  33.19 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  43.86 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  39.18 
 
 		 313 aa  164  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  41.35 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  40.17 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  37.18 
 
 		 242 aa  158  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  38.01 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  39.75 
 
 		 254 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  40.25 
 
 		 241 aa  151  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  34.27 
 
 		 318 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  36.17 
 
 		 301 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  34.47 
 
 		 321 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  36.14 
 
 		 286 aa  148  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  34.93 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  35.42 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  33.68 
 
 		 303 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  35.29 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  33.81 
 
 		 340 aa  145  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  34.91 
 
 		 247 aa  145  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  38.12 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  33.83 
 
 		 303 aa  144  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  37.22 
 
 		 244 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  38.12 
 
 		 244 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  38.13 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  33.45 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  35.64 
 
 		 281 aa  143  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  31.95 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  35.04 
 
 		 281 aa  138  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  32.87 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  37.1 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  33.81 
 
 		 312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  32.63 
 
 		 289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  39.33 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  31.76 
 
 		 251 aa  132  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  31.25 
 
 		 272 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  34.96 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  34.14 
 
 		 296 aa  131  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  31.91 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  32.5 
 
 		 290 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  34.93 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  31.84 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  34.57 
 
 		 280 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  31.6 
 
 		 295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  35.59 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  31.06 
 
 		 322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  32.17 
 
 		 312 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  30.45 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  34.45 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  30.72 
 
 		 336 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  32.44 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  34.29 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  34.01 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  30.71 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  34.41 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  30.38 
 
 		 325 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  30.72 
 
 		 303 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  30.72 
 
 		 303 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  32.1 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  30.72 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  33.75 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  47.26 
 
 		 166 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  31.7 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3016  hypothetical protein  38.33 
 
 		 242 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  31.69 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>