277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1232 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
270 aa  543  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  46.01 
 
 
265 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  46.3 
 
 
282 aa  215  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  41.29 
 
 
268 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  42.91 
 
 
268 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  41.89 
 
 
268 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  42.97 
 
 
290 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  44.31 
 
 
272 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  43.66 
 
 
273 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  41.54 
 
 
264 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  41.8 
 
 
263 aa  201  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  39.31 
 
 
267 aa  201  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  42.31 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  39.55 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  39.31 
 
 
267 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  41.41 
 
 
248 aa  195  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  43.24 
 
 
259 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  42.58 
 
 
309 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  39.25 
 
 
267 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  41.35 
 
 
259 aa  192  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  41.89 
 
 
254 aa  192  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  38.02 
 
 
267 aa  191  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  42.86 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  39.45 
 
 
267 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  42.57 
 
 
259 aa  188  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  41.18 
 
 
264 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  38.58 
 
 
274 aa  185  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  38.93 
 
 
267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  39.03 
 
 
316 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  40.15 
 
 
265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  37.26 
 
 
261 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04829  DUF72  48.24 
 
 
203 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  39.58 
 
 
325 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  37.88 
 
 
268 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  36.46 
 
 
303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  37.2 
 
 
293 aa  166  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  34.86 
 
 
301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  37.02 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  39.08 
 
 
312 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  35.64 
 
 
308 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  36.04 
 
 
340 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  34.84 
 
 
303 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  34.75 
 
 
286 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  36.18 
 
 
296 aa  155  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  34.38 
 
 
295 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  36.36 
 
 
322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  33.92 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  36.14 
 
 
336 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  37.15 
 
 
312 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  36.17 
 
 
289 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  35.07 
 
 
305 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  37.65 
 
 
305 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  41.22 
 
 
303 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  41.22 
 
 
303 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  41.22 
 
 
303 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  37.85 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  37.96 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  36.36 
 
 
303 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  34.98 
 
 
308 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  32.76 
 
 
281 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  35.66 
 
 
277 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  35.93 
 
 
288 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  30.74 
 
 
313 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  34.98 
 
 
281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  35.46 
 
 
282 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  36.55 
 
 
244 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  37.34 
 
 
244 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  37.09 
 
 
254 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  34.25 
 
 
251 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  37.34 
 
 
246 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  31.94 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  33.51 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  36.56 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  35.57 
 
 
249 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  31.92 
 
 
249 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  27.52 
 
 
252 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  35.57 
 
 
249 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  35.05 
 
 
249 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  31.34 
 
 
243 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 
240 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  31.82 
 
 
271 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  31.77 
 
 
242 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  32.41 
 
 
242 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  29.6 
 
 
245 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  29.6 
 
 
245 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  29.24 
 
 
247 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  29.81 
 
 
256 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  29.09 
 
 
251 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  30.48 
 
 
243 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  30.56 
 
 
242 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  32.56 
 
 
243 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  34.22 
 
 
241 aa  98.6  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  28.9 
 
 
244 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  31.94 
 
 
246 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  29.36 
 
 
244 aa  95.5  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  33.16 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  38.93 
 
 
166 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  28.57 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  31.86 
 
 
254 aa  92.8  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  28.8 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>