269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3659 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  90.26 
 
 		 267 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  86.47 
 
 		 268 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  79.23 
 
 		 274 aa  434  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  78.24 
 
 		 264 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  76.69 
 
 		 267 aa  427  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  77.82 
 
 		 267 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  63.91 
 
 		 268 aa  348  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  64.37 
 
 		 268 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  60.94 
 
 		 263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  60.46 
 
 		 264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  57.74 
 
 		 268 aa  322  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  58.11 
 
 		 267 aa  321  9.000000000000001e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  59.54 
 
 		 273 aa  319  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  58.33 
 
 		 272 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  56.76 
 
 		 267 aa  316  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  58.14 
 
 		 279 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  53.46 
 
 		 309 aa  299  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  54.89 
 
 		 261 aa  292  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  54.88 
 
 		 290 aa  291  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  57.83 
 
 		 269 aa  291  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  52.65 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  56.42 
 
 		 265 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  57.43 
 
 		 259 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  54.51 
 
 		 265 aa  286  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  54.47 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  54.86 
 
 		 259 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  50.19 
 
 		 282 aa  277  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  50.38 
 
 		 254 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  50.78 
 
 		 259 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  51.91 
 
 		 268 aa  271  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  47.06 
 
 		 301 aa  262  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  43.6 
 
 		 318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  43.55 
 
 		 303 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  45.04 
 
 		 340 aa  240  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  43.94 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  48.3 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  43.84 
 
 		 293 aa  231  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  45.99 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  42.56 
 
 		 312 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  42.55 
 
 		 286 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  46.45 
 
 		 296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  42.96 
 
 		 350 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  42.61 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  42.96 
 
 		 312 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  41.13 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  41.28 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  40.56 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  40.14 
 
 		 303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  40.14 
 
 		 303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  40.14 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  41.61 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  40.75 
 
 		 321 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  39.86 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  38.85 
 
 		 322 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  41.75 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  37.84 
 
 		 336 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  37.06 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  38.83 
 
 		 308 aa  195  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  40.07 
 
 		 282 aa  192  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  37.73 
 
 		 288 aa  185  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  39.68 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  37.93 
 
 		 281 aa  181  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  45.28 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  39.25 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04829  DUF72  41.21 
 
 		 203 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  31.95 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  38.36 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  33.07 
 
 		 264 aa  131  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  30.27 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  36.49 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  35.32 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  31.3 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  32.95 
 
 		 247 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  29.89 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  33.49 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  32.31 
 
 		 242 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  31.09 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  32.11 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  31.09 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  34.7 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  30.41 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  37.91 
 
 		 279 aa  118  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  32.82 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  27.91 
 
 		 244 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  32.95 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  27.97 
 
 		 244 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  33.21 
 
 		 240 aa  115  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  31.51 
 
 		 243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  32.06 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  31.8 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  31.58 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  28.68 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  31.53 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  32.14 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  29.66 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  33.94 
 
 		 249 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  32.38 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  29.12 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>