118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04829 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04829  DUF72  100 
 
 		 203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  49.5 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  46.53 
 
 		 264 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  51.6 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  49.5 
 
 		 309 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  43.22 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  44.78 
 
 		 282 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  43.28 
 
 		 259 aa  161  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  43.28 
 
 		 254 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  44.12 
 
 		 261 aa  160  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  41.21 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  42.57 
 
 		 268 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  41.21 
 
 		 267 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  43.65 
 
 		 265 aa  155  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  39.41 
 
 		 267 aa  154  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  40.59 
 
 		 268 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  41.41 
 
 		 267 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  41.09 
 
 		 265 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  48.24 
 
 		 270 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  41.29 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  40.5 
 
 		 263 aa  150  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  39.6 
 
 		 274 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  41.79 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  38.61 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  36.32 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  41.79 
 
 		 264 aa  145  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  39.5 
 
 		 279 aa  141  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  39 
 
 		 268 aa  141  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  39.3 
 
 		 248 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  34.7 
 
 		 301 aa  134  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  36.61 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  38.05 
 
 		 325 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  41.88 
 
 		 269 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  36.73 
 
 		 336 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  35.56 
 
 		 308 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  38.12 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  36.73 
 
 		 322 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  40.31 
 
 		 259 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  39.39 
 
 		 268 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  33.33 
 
 		 318 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  33.78 
 
 		 295 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  37.44 
 
 		 293 aa  121  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  35.43 
 
 		 340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  36.73 
 
 		 303 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  36.73 
 
 		 303 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  35.11 
 
 		 305 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  36.73 
 
 		 303 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  35.56 
 
 		 350 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  31.7 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  33.78 
 
 		 303 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  33.04 
 
 		 289 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  34.65 
 
 		 321 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  36.49 
 
 		 296 aa  109  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  34.65 
 
 		 288 aa  108  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  33.62 
 
 		 308 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  35.24 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  31.56 
 
 		 303 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  32.44 
 
 		 312 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  33.18 
 
 		 312 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  32.13 
 
 		 303 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  29.33 
 
 		 313 aa  88.2  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  29.65 
 
 		 277 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  32.22 
 
 		 281 aa  86.3  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  29.39 
 
 		 282 aa  85.5  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  29.74 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  35.48 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  28.25 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  34.21 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  34.21 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  31.79 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  31.21 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  30.81 
 
 		 264 aa  72  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  32.03 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  37.31 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  29.41 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  31.76 
 
 		 243 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  24.34 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  36.15 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  32 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  29.75 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  26.97 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  31.15 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  30.05 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  30.72 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  25.66 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  28.95 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  28.08 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  31.01 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  31.41 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  25.37 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  28.95 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  29.47 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  29.3 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  29.94 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  31.41 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  31.41 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  31.41 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  22.97 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>