279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3671 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  100 
 
 		 321 aa  650    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  58.84 
 
 		 308 aa  354  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  60.14 
 
 		 286 aa  342  4e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  60.76 
 
 		 350 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  58.84 
 
 		 303 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  58.31 
 
 		 305 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  56.08 
 
 		 318 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  59.52 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  60.14 
 
 		 312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  55.82 
 
 		 325 aa  326  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  58.74 
 
 		 295 aa  326  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  59.93 
 
 		 312 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  57.04 
 
 		 340 aa  322  8e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  53.04 
 
 		 322 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  57.19 
 
 		 289 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  57.39 
 
 		 303 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  55.48 
 
 		 336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  56.36 
 
 		 301 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  58.31 
 
 		 296 aa  316  4e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  54.11 
 
 		 308 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  57 
 
 		 293 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  56.06 
 
 		 277 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  54.27 
 
 		 303 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  54.79 
 
 		 282 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  57.99 
 
 		 288 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  54.45 
 
 		 303 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  54.45 
 
 		 303 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  54.45 
 
 		 303 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  52.23 
 
 		 281 aa  291  8e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  53.47 
 
 		 313 aa  286  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  48.81 
 
 		 281 aa  255  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  43.75 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  41.44 
 
 		 264 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  42.12 
 
 		 263 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  41.3 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  42.36 
 
 		 254 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  41.92 
 
 		 282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  41.75 
 
 		 273 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  40.21 
 
 		 267 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  40.75 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  41.11 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  41.2 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  38.49 
 
 		 268 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  37.85 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  39.04 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  43.17 
 
 		 269 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  36.74 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  40.73 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  41.24 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  36.81 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  42.81 
 
 		 259 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  42.75 
 
 		 259 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  40.77 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  38.28 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  40.07 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  39.1 
 
 		 267 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  37.41 
 
 		 274 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  39.86 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  38.54 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  38.11 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  36.68 
 
 		 268 aa  186  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  37.98 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  37.8 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  38.6 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  36.24 
 
 		 251 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  35.22 
 
 		 252 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  36.79 
 
 		 243 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  36.59 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  36.59 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  36.43 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  35.74 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  35.96 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  34.47 
 
 		 243 aa  149  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  36.3 
 
 		 241 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  37.85 
 
 		 270 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  32.27 
 
 		 244 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  31.06 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  33.57 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  31.47 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  35.19 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  30.99 
 
 		 247 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  33.45 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  35.11 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  34.35 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  32.87 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  33.56 
 
 		 242 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  29.82 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  33.45 
 
 		 243 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  33.1 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  37.61 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  36.36 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  33.91 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  30.31 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  32.47 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  36.32 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  34.98 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  33.68 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  33.22 
 
 		 249 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  34.6 
 
 		 246 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  29.56 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>