267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4434 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  100 
 
 		 256 aa  539  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  51.43 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  46.38 
 
 		 246 aa  218  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  37.08 
 
 		 249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  36.67 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  36.25 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  32.39 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  34.54 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  34.96 
 
 		 243 aa  132  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  33.86 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  31.56 
 
 		 252 aa  125  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  30.45 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  33.47 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  32.4 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  34 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  34.31 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  35.96 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  35.96 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  34.57 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  34.57 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  34.57 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  34.01 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 		 242 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  30.89 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  33.62 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  34.5 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  31.08 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  31.43 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  32.02 
 
 		 244 aa  111  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  31.74 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  31.47 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  31.98 
 
 		 241 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  29.57 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  29.66 
 
 		 251 aa  105  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  31.7 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  31.85 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0421  protein of unknown function DUF72  29.41 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.738835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  31.88 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  29.6 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  31.12 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0190  hypothetical protein  32.64 
 
 		 256 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.665614  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  30.05 
 
 		 234 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  32.26 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  30.29 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  29.3 
 
 		 254 aa  98.6  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  27.85 
 
 		 276 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  31.73 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  29.2 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  32.06 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  30.48 
 
 		 280 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9057  hypothetical protein  33.52 
 
 		 221 aa  95.1  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  29.93 
 
 		 318 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  28.99 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  28.46 
 
 		 241 aa  93.2  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  27.55 
 
 		 305 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  29.67 
 
 		 303 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  29.67 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  27.48 
 
 		 312 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5900  hypothetical protein  31.54 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  28.94 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  30.04 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  30.71 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  29.79 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  32.77 
 
 		 387 aa  90.1  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3871  hypothetical protein  36.3 
 
 		 203 aa  89.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  28.64 
 
 		 282 aa  89.7  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  29.26 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  28.93 
 
 		 243 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  28.14 
 
 		 254 aa  89  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  26.95 
 
 		 293 aa  89  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  26.34 
 
 		 312 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  31 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  30.34 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0131  hypothetical protein  30.86 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.333529  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  29.7 
 
 		 286 aa  86.3  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04163  hypothetical protein  31.61 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1478  protein of unknown function DUF72  32.64 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.864912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  28.41 
 
 		 313 aa  85.9  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  28.04 
 
 		 295 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  26.84 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  29.25 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  27.95 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  32.62 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  28.7 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  27.61 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  30.28 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  29.56 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  25 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  28.52 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  32.41 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  27.96 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  26.29 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  24.64 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5493  hypothetical protein  27.76 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.0343585 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  28.44 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  29.82 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  33.58 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  26.94 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  26.79 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  28.37 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>