243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0081 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  75.27 
 
 
283 aa  431  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  74.55 
 
 
283 aa  424  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  75.56 
 
 
276 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  68.36 
 
 
275 aa  394  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  68.73 
 
 
275 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  67.38 
 
 
286 aa  380  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  39.71 
 
 
277 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  44.61 
 
 
288 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  39.35 
 
 
288 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  38.78 
 
 
317 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  38.78 
 
 
317 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  38.78 
 
 
317 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  38.78 
 
 
317 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  44.24 
 
 
288 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  45.49 
 
 
284 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  42.8 
 
 
289 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  39.85 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  41.06 
 
 
289 aa  195  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  42.7 
 
 
287 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  38.85 
 
 
289 aa  192  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  38.91 
 
 
301 aa  189  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  37.87 
 
 
298 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  40.91 
 
 
289 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  38.72 
 
 
316 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  39.77 
 
 
289 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  38.96 
 
 
277 aa  185  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  39.39 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  37.74 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  39.39 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  40.91 
 
 
286 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  38.13 
 
 
317 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  34.8 
 
 
300 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  37.7 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  37.37 
 
 
292 aa  171  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  38.27 
 
 
272 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  38.27 
 
 
272 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.256833 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  38.27 
 
 
272 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  38.27 
 
 
272 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  36.12 
 
 
272 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  38.27 
 
 
272 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  37.86 
 
 
272 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  36.71 
 
 
313 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  38.27 
 
 
272 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  38.27 
 
 
272 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  42.03 
 
 
245 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  34.75 
 
 
271 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  35.74 
 
 
272 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  35.74 
 
 
272 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  35.74 
 
 
272 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  35.36 
 
 
272 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  36.89 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  36.36 
 
 
271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  33.96 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  33.96 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  33.96 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  36.07 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  36.63 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  34.4 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  32.45 
 
 
284 aa  141  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  35.48 
 
 
284 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  35.31 
 
 
293 aa  138  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  28.14 
 
 
287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  29.89 
 
 
283 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  30 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  34.08 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  25.94 
 
 
293 aa  115  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  37.28 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  31.71 
 
 
243 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  37.28 
 
 
244 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  35.5 
 
 
244 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  31.15 
 
 
243 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  37.04 
 
 
241 aa  91.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  40.15 
 
 
264 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  28.8 
 
 
247 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  30.83 
 
 
279 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  29.39 
 
 
240 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  25.27 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  29.55 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  27.6 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  34.01 
 
 
249 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  26.07 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  31.21 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  31.51 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  25.81 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  21.74 
 
 
314 aa  82.4  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  44.26 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  33.93 
 
 
245 aa  82  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  33.93 
 
 
245 aa  82  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3871  hypothetical protein  48.86 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  33.11 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  35.03 
 
 
251 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  37.5 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  24.55 
 
 
237 aa  79  0.00000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  33.14 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  32.86 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  36.02 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  28.79 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  37.76 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>