282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0893 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  655    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  95.89 
 
 
316 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  91.8 
 
 
317 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  70.98 
 
 
317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  70.98 
 
 
317 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  70.35 
 
 
317 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  70.35 
 
 
317 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  71.48 
 
 
298 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  83.48 
 
 
245 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  63.12 
 
 
301 aa  364  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  57.19 
 
 
289 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  54.49 
 
 
288 aa  332  6e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  54.3 
 
 
313 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  54.64 
 
 
277 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  45.55 
 
 
272 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  45.55 
 
 
272 aa  249  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  45.55 
 
 
272 aa  249  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  45.55 
 
 
272 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  45.55 
 
 
272 aa  249  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  45.55 
 
 
272 aa  249  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  45.21 
 
 
272 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  45.21 
 
 
272 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  44.21 
 
 
271 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  44.21 
 
 
271 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  44.21 
 
 
271 aa  242  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  45.13 
 
 
271 aa  241  9e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  43.84 
 
 
272 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  41.61 
 
 
280 aa  240  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  48.12 
 
 
272 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  43.84 
 
 
272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  43.84 
 
 
272 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  43.84 
 
 
272 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  43.84 
 
 
272 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  43.37 
 
 
270 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  46.15 
 
 
270 aa  235  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  45 
 
 
277 aa  235  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  44 
 
 
271 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  42.25 
 
 
289 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  43.27 
 
 
287 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  43.15 
 
 
289 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  44.16 
 
 
284 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  43.27 
 
 
270 aa  222  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  40.14 
 
 
289 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  39.34 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  39.08 
 
 
289 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  38.73 
 
 
289 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  38.73 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  39.58 
 
 
286 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  42.61 
 
 
286 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  38.93 
 
 
275 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  37.98 
 
 
283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  36.5 
 
 
287 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  39.01 
 
 
288 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  37.18 
 
 
292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  38.65 
 
 
288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  38.35 
 
 
275 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  37.63 
 
 
275 aa  192  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  38.79 
 
 
276 aa  192  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  36.84 
 
 
283 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  35.25 
 
 
293 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  35.04 
 
 
293 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  31.46 
 
 
284 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  33.45 
 
 
284 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  32.52 
 
 
283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  29.35 
 
 
290 aa  142  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  29.53 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  26.67 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  29.76 
 
 
243 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  25.67 
 
 
314 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  26.9 
 
 
308 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  26.99 
 
 
291 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  38.03 
 
 
246 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  26.55 
 
 
252 aa  93.2  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  36.24 
 
 
241 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  22.33 
 
 
303 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  26.52 
 
 
247 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  21.68 
 
 
293 aa  89.4  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  36.03 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  36.03 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  27.27 
 
 
313 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  33.79 
 
 
249 aa  87  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  33.79 
 
 
249 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  32.54 
 
 
244 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  33.92 
 
 
259 aa  85.9  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  34.27 
 
 
249 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  32.76 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  33.71 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  33.11 
 
 
244 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  31.15 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  30 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  33.92 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  30.89 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  23.76 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  35.29 
 
 
237 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  23.76 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  23.76 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  24.82 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  34.52 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  32.88 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>