277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1053.2 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  82.46 
 
 		 317 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  82.46 
 
 		 317 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  81.58 
 
 		 317 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  82.02 
 
 		 317 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  81.22 
 
 		 316 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  83.48 
 
 		 316 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  79.91 
 
 		 317 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  76.06 
 
 		 298 aa  345  5e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  69.52 
 
 		 301 aa  307  8e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  62.39 
 
 		 313 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  61.14 
 
 		 288 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  58.77 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  60.19 
 
 		 277 aa  266  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  52.88 
 
 		 272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  47.95 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  50.71 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  50.71 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  50.71 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  50.71 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  50.71 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  50.71 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  50.24 
 
 		 272 aa  211  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  50.24 
 
 		 272 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  50.96 
 
 		 272 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  50.96 
 
 		 272 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  50.96 
 
 		 272 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  50.96 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  50.96 
 
 		 272 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  46.95 
 
 		 270 aa  208  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  45.79 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  47.6 
 
 		 271 aa  205  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  47.12 
 
 		 271 aa  202  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  46.73 
 
 		 271 aa  201  9e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  46.73 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  46.73 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  42.92 
 
 		 300 aa  198  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  46.15 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  43.6 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  42.11 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  42.31 
 
 		 289 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  44.71 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  44.24 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  41.15 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  41.15 
 
 		 289 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  41.15 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  42.11 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  39.34 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  41.15 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  41.12 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  42.38 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  42.03 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  41.9 
 
 		 288 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  38.5 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  41.55 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  38.12 
 
 		 283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  39.55 
 
 		 293 aa  158  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  38.54 
 
 		 275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  38.54 
 
 		 275 aa  154  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  38.97 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  42.11 
 
 		 286 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  36.28 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  34.43 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  34.56 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  32.56 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  31.73 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  29.95 
 
 		 314 aa  96.3  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  31.55 
 
 		 299 aa  92.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  28.77 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  33.56 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  32.97 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  30.41 
 
 		 308 aa  88.6  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  32.93 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  33.79 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  33.79 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  34.27 
 
 		 249 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  35.11 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  33.53 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  29.28 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  33.55 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  29.51 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  35.29 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  37.76 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  33.86 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  29.51 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  31.69 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  35.29 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  29.51 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  30.54 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  30.28 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  34.53 
 
 		 313 aa  81.6  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  29.28 
 
 		 276 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  31.72 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  30.99 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  35.66 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  39.45 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  33.13 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  30.3 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  26.82 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  30.18 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>