189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1813 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  559  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  93.7 
 
 		 270 aa  523  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  69.26 
 
 		 270 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  71.11 
 
 		 270 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  71.15 
 
 		 271 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  68.27 
 
 		 271 aa  384  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  68.27 
 
 		 271 aa  384  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  68.27 
 
 		 271 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  61.4 
 
 		 272 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  62.5 
 
 		 272 aa  353  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  62.5 
 
 		 272 aa  353  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  62.5 
 
 		 272 aa  353  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  61.4 
 
 		 272 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  61.4 
 
 		 272 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  62.5 
 
 		 272 aa  353  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  61.4 
 
 		 272 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  61.4 
 
 		 272 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  62.5 
 
 		 272 aa  353  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  62.13 
 
 		 272 aa  352  5e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  62.13 
 
 		 272 aa  351  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  62.13 
 
 		 272 aa  351  7e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  59.19 
 
 		 272 aa  338  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  47.88 
 
 		 288 aa  244  9e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  46.13 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  47.5 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  47.58 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  45.76 
 
 		 317 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  45.39 
 
 		 317 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  45.39 
 
 		 317 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  49.39 
 
 		 277 aa  234  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  44.81 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  44.44 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  44.11 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  44.22 
 
 		 277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  45.56 
 
 		 317 aa  218  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  44.4 
 
 		 313 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  47.12 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  42.07 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  40.96 
 
 		 288 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  42.08 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  40.07 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  39.78 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  39.63 
 
 		 289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  37.73 
 
 		 289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  37.73 
 
 		 289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  38.32 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  37.73 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  40.45 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  36.33 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  36.67 
 
 		 283 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  35.69 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  36.13 
 
 		 275 aa  166  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  35.97 
 
 		 283 aa  165  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  36.36 
 
 		 275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  39.26 
 
 		 286 aa  165  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  36.36 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  37.45 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  35.4 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  35.91 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  36.84 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  36.9 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  35.02 
 
 		 284 aa  145  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  34.81 
 
 		 284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  37.79 
 
 		 290 aa  141  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  30.6 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  31.01 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  26.64 
 
 		 314 aa  96.3  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  27.75 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  26.09 
 
 		 299 aa  89.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  28.45 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  24.63 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  22.44 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  25.5 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  26.67 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  33.58 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  25 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  29.24 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  28.28 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  29.82 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  31.4 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  35.51 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  32.37 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  33.83 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  25.59 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  23.4 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  28.07 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  30.14 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  32.37 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  36.61 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  25.63 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  33.58 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  28.66 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  30.36 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  30.94 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  29.71 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  30.94 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  28.32 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  31.46 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  28.06 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  31.01 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>