255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6252 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  569  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  78.8 
 
 		 283 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  75.27 
 
 		 275 aa  427  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  74.55 
 
 		 275 aa  424  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  76 
 
 		 275 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1926  protein of unknown function DUF72  70.74 
 
 		 276 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127061  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  63.07 
 
 		 286 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  40.29 
 
 		 317 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0880  hypothetical protein  39.93 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3407  protein of unknown function DUF72  40.29 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  40.29 
 
 		 317 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  41.03 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1455  hypothetical protein  42.34 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16730  hypothetical protein  42.12 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.278472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01596  hypothetical protein  38.97 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0893  hypothetical protein  39.19 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2877 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2161  hypothetical protein  40.37 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  43.08 
 
 		 284 aa  195  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0928  hypothetical protein  39.19 
 
 		 316 aa  195  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.244056 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003927  hypothetical protein  37.91 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000613561  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0604  hypothetical protein  40.08 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1114  hypothetical protein  40.15 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.718308  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1509  hypothetical protein  39.41 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4108  hypothetical protein  40.52 
 
 		 289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4213  hypothetical protein  39.03 
 
 		 289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.789582 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0734  hypothetical protein  36.97 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000268546  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3355  hypothetical protein  38.66 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3275  hypothetical protein  37.87 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00809746  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3044  hypothetical protein  38.03 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0242225  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  38.54 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  38.15 
 
 		 289 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2604  hypothetical protein  36.3 
 
 		 272 aa  179  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256833 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1318  hypothetical protein  36.3 
 
 		 272 aa  178  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01839  hypothetical protein  36.3 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1772  protein of unknown function DUF72  36.3 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000180471  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1962  hypothetical protein  36.3 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01827  hypothetical protein  36.3 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1764  hypothetical protein  36.3 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2099  hypothetical protein  35.93 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2427  hypothetical protein  36.47 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.458835  normal  0.080753 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2149  hypothetical protein  36.47 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.310023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2036  hypothetical protein  36.47 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1220  hypothetical protein  36.23 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1344  hypothetical protein  36.23 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562347  hitchhiker  0.00116733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2062  hypothetical protein  36.23 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2057  hypothetical protein  36.23 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.778846  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1322  hypothetical protein  38.49 
 
 		 287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2117  hypothetical protein  35.87 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.542905  hitchhiker  0.000239211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1977  protein of unknown function DUF72  36.92 
 
 		 292 aa  172  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2784  hypothetical protein  34.98 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.128438  normal  0.0380148 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  41.12 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1813  hypothetical protein  36.67 
 
 		 271 aa  169  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2263  hypothetical protein  36.3 
 
 		 270 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1073  hypothetical protein  38.15 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666146  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01726  hypothetical protein  36.25 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2097  hypothetical protein  35.56 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  32.73 
 
 		 300 aa  165  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2436  hypothetical protein  35.19 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  152  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  34.72 
 
 		 293 aa  148  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  34.48 
 
 		 284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  33.94 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  31.8 
 
 		 283 aa  135  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  31.21 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3776  hypothetical protein  27.41 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  25.89 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  37.58 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  36.63 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  36.63 
 
 		 244 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  37.74 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  25.47 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2929  protein of unknown function DUF72  23.67 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  25.86 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  29.88 
 
 		 243 aa  92  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  91.3  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  37.93 
 
 		 166 aa  89  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  33.54 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  35.03 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  36.36 
 
 		 243 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  34.93 
 
 		 241 aa  86.3  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  34.69 
 
 		 279 aa  85.9  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  24.69 
 
 		 247 aa  86.3  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  34.66 
 
 		 249 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  29.88 
 
 		 252 aa  85.5  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  25.35 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  38.69 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  35.48 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  34.29 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  34.29 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  37.09 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  35.57 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  37.93 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  31.55 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1385  hypothetical protein  32.65 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5530  protein of unknown function DUF72  26.48 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  35.76 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  35.53 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  27.41 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  30 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  28 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>