285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6330 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  46.09 
 
 
259 aa  227  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  48.73 
 
 
244 aa  225  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  50 
 
 
243 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  45.45 
 
 
254 aa  218  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  51.11 
 
 
249 aa  218  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0190  hypothetical protein  49.37 
 
 
256 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.665614  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  47.21 
 
 
245 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  44.21 
 
 
241 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5900  hypothetical protein  50.63 
 
 
256 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393908 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  41.81 
 
 
230 aa  192  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1478  protein of unknown function DUF72  48.51 
 
 
251 aa  185  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.864912  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04163  hypothetical protein  45.26 
 
 
241 aa  182  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9057  hypothetical protein  41.41 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3871  hypothetical protein  54.74 
 
 
203 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  29.96 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  32.64 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  27.98 
 
 
246 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  29.51 
 
 
247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  29.71 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  31.22 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  30.08 
 
 
242 aa  113  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  31.87 
 
 
248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  30.11 
 
 
313 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  33.48 
 
 
254 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  31.65 
 
 
249 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  29.1 
 
 
256 aa  108  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  31.64 
 
 
282 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  30.8 
 
 
249 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  30.38 
 
 
249 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  30.34 
 
 
243 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  28.27 
 
 
251 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  30.08 
 
 
277 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  30.17 
 
 
261 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  31.3 
 
 
240 aa  102  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  30.08 
 
 
279 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  28.27 
 
 
256 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  28.57 
 
 
281 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  28.81 
 
 
261 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  30.42 
 
 
288 aa  99.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  30.74 
 
 
242 aa  99.4  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  29.88 
 
 
243 aa  99.4  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  29.86 
 
 
301 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  28.72 
 
 
340 aa  98.2  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  28.47 
 
 
321 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  27.66 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  30.54 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  29.44 
 
 
240 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  28.11 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  27.82 
 
 
303 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  29.88 
 
 
242 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  34.24 
 
 
246 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  26.75 
 
 
244 aa  96.3  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  26.53 
 
 
246 aa  95.9  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  30.94 
 
 
244 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  29.57 
 
 
244 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  31.55 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  29.39 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  26.97 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  26.99 
 
 
318 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  29.78 
 
 
296 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  28.03 
 
 
308 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  28.75 
 
 
236 aa  93.2  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  27.97 
 
 
303 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  30.81 
 
 
271 aa  92.8  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  27.97 
 
 
303 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  28.57 
 
 
325 aa  92.4  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  27.49 
 
 
244 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  27.49 
 
 
244 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  26.21 
 
 
244 aa  92  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  30.74 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  32.08 
 
 
245 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  26.64 
 
 
281 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  32.08 
 
 
245 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  27.97 
 
 
303 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  27.49 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  27.08 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  26.03 
 
 
295 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  28.93 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  26.13 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  28.02 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  27.02 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  28.99 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1082  protein of unknown function DUF72  28.83 
 
 
228 aa  89.7  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00357332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  35.37 
 
 
166 aa  88.6  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  28.27 
 
 
242 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0205  hypothetical protein  31.56 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.967531 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  27.54 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  26.99 
 
 
336 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0131  hypothetical protein  28.85 
 
 
240 aa  87.8  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.333529  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  28.1 
 
 
387 aa  87.4  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  26.99 
 
 
322 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1859  hypothetical protein  29.34 
 
 
231 aa  87  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.868685  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  32.95 
 
 
283 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  29.38 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  29.89 
 
 
303 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  30.23 
 
 
267 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  34.93 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  26.83 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  29.86 
 
 
268 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>