291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1478 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1478  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
251 aa  511  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.864912  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5900  hypothetical protein  65.06 
 
 
256 aa  298  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393908 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  56.33 
 
 
245 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  53.28 
 
 
254 aa  254  7e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  50 
 
 
244 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2381  hypothetical protein  51.09 
 
 
243 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190357 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  49 
 
 
259 aa  236  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0190  hypothetical protein  53.81 
 
 
256 aa  229  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.665614  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  49.13 
 
 
241 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  53.64 
 
 
249 aa  219  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  49.58 
 
 
276 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  44.1 
 
 
230 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04163  hypothetical protein  46.4 
 
 
241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9057  hypothetical protein  44.12 
 
 
221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3871  hypothetical protein  54.96 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  35.14 
 
 
313 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  38.11 
 
 
279 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  34.45 
 
 
256 aa  120  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  30.77 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  29.87 
 
 
246 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  35.02 
 
 
249 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  37.76 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  35.78 
 
 
254 aa  108  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  32.64 
 
 
256 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  32.07 
 
 
301 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  34.32 
 
 
249 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  35.02 
 
 
249 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  35.62 
 
 
261 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  40.37 
 
 
246 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  30.63 
 
 
247 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  32.85 
 
 
282 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  34.82 
 
 
242 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  31.98 
 
 
256 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  35.47 
 
 
241 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  34.39 
 
 
251 aa  102  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  34.47 
 
 
256 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  32.38 
 
 
261 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  33.33 
 
 
271 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  39.75 
 
 
244 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  33.78 
 
 
243 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  39.13 
 
 
244 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  33.75 
 
 
249 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  29.29 
 
 
312 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  37.78 
 
 
284 aa  98.6  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  33.19 
 
 
244 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  32.26 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  30.24 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  31.67 
 
 
303 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  31.05 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  35.4 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4365  protein of unknown function DUF72  37.36 
 
 
166 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649096  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  33.19 
 
 
244 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  30.07 
 
 
318 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  33.19 
 
 
244 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  30.4 
 
 
277 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  29.21 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  31.34 
 
 
274 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  29 
 
 
350 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  31.38 
 
 
243 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  31.8 
 
 
267 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  35.27 
 
 
245 aa  95.9  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  27.03 
 
 
305 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  35.27 
 
 
245 aa  95.9  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  31.22 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  31.73 
 
 
281 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  31.34 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  33.2 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  34.07 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  33.78 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  26.76 
 
 
308 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  27.67 
 
 
305 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  30.93 
 
 
240 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  29.8 
 
 
299 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  29.61 
 
 
237 aa  91.7  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  29.95 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  29.28 
 
 
321 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  28.82 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  28.74 
 
 
293 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  30.12 
 
 
288 aa  89.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  28.81 
 
 
246 aa  89.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39260  hypothetical protein  36.87 
 
 
284 aa  88.6  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  31.28 
 
 
267 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  28.64 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  30.08 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  31.02 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  33.15 
 
 
293 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  39.16 
 
 
275 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  31.25 
 
 
309 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  31.25 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  29.03 
 
 
267 aa  86.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  33.33 
 
 
284 aa  85.5  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  28.52 
 
 
281 aa  85.5  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  28.44 
 
 
240 aa  85.1  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  30.08 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  36.84 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  29.92 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  30.08 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  33.71 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  29.17 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  27.98 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>