263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0235 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0235  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  43.08 
 
 
286 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  38.49 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0430  hypothetical protein  38.78 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0458  protein of unknown function DUF72  38.4 
 
 
301 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1898  hypothetical protein  34.09 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.652332  normal  0.220603 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2229  hypothetical protein  34.46 
 
 
272 aa  140  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0459  protein of unknown function DUF72  37.64 
 
 
300 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1295  hypothetical protein  32.95 
 
 
261 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1160  hypothetical protein  32.95 
 
 
261 aa  137  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4140  hypothetical protein  38.49 
 
 
296 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950206  hitchhiker  0.001504 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0315  protein of unknown function DUF72  32.45 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2992  hypothetical protein  32.47 
 
 
272 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0078078  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0209  hypothetical protein  35.16 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1936  hypothetical protein  32.96 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  30.98 
 
 
240 aa  130  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0310  hypothetical protein  32.83 
 
 
279 aa  128  8.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000867171  normal  0.131792 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  30.27 
 
 
387 aa  123  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0778  hypothetical protein  30.35 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0720  hypothetical protein  30.04 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0939  hypothetical protein  32.33 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0920  hypothetical protein  32.33 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106512  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  32.95 
 
 
248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  29.5 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0508  hypothetical protein  28.57 
 
 
282 aa  116  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0421  protein of unknown function DUF72  28.84 
 
 
267 aa  112  6e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.738835  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1873  protein of unknown function DUF72  32.71 
 
 
293 aa  109  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  32.55 
 
 
243 aa  108  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2914  protein of unknown function DUF72  30.51 
 
 
282 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3062  protein of unknown function DUF72  31.52 
 
 
286 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1382  hypothetical protein  27.41 
 
 
281 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5842  protein of unknown function DUF72  31.15 
 
 
306 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.852032  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  32.57 
 
 
244 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2197  protein of unknown function DUF72  27.74 
 
 
295 aa  105  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00260465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1620  hypothetical protein  27.78 
 
 
281 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2045  hypothetical protein  30.82 
 
 
306 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.148398  normal  0.484103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  32.57 
 
 
244 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2030  protein of unknown function DUF72  28.47 
 
 
318 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  32.57 
 
 
244 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3831  hypothetical protein  27.04 
 
 
281 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000400731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1514  hypothetical protein  27.41 
 
 
281 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  29.84 
 
 
251 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  29.39 
 
 
246 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1584  hypothetical protein  26.67 
 
 
281 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.487764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1368  hypothetical protein  26.3 
 
 
281 aa  99  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1479  hypothetical protein  26.3 
 
 
281 aa  99  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  28.68 
 
 
271 aa  99  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1341  hypothetical protein  26.3 
 
 
281 aa  98.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1340  hypothetical protein  26.3 
 
 
281 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.462218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1551  hypothetical protein  26.3 
 
 
281 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  32.2 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5493  hypothetical protein  28.33 
 
 
321 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.0343585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  29.66 
 
 
242 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  31.4 
 
 
240 aa  96.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  27.52 
 
 
251 aa  95.9  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1183  hypothetical protein  27.41 
 
 
281 aa  95.9  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000897763  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  26.17 
 
 
242 aa  95.9  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  30.38 
 
 
243 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4589  hypothetical protein  29.29 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135422  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  27.13 
 
 
236 aa  95.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  30 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  29.85 
 
 
241 aa  93.6  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  27.97 
 
 
242 aa  93.2  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  29.74 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  31.64 
 
 
241 aa  92.8  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  27.48 
 
 
244 aa  92.4  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3896  hypothetical protein  27.15 
 
 
298 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  27.68 
 
 
256 aa  92.4  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  29.8 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  31.03 
 
 
241 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  27.97 
 
 
237 aa  89.7  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  29.12 
 
 
313 aa  90.1  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  27.92 
 
 
251 aa  90.1  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  29.17 
 
 
246 aa  89  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  29.69 
 
 
281 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  28.85 
 
 
242 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  27.52 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1271  protein of unknown function DUF72  27.84 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000066434  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  27.69 
 
 
244 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  28.4 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  28.4 
 
 
242 aa  86.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  33.93 
 
 
244 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1134  hypothetical protein  30.2 
 
 
231 aa  85.9  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.324615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  28.12 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0131  hypothetical protein  30.3 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.333529  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  27.44 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  28.74 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  29.5 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  32.74 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  28.74 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1385  hypothetical protein  28.7 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  31.98 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  30.53 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  27.97 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  26.52 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  31.63 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1082  protein of unknown function DUF72  25.7 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00357332  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  26.97 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  26.37 
 
 
301 aa  75.5  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>