190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0209 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0209  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  585  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1514  hypothetical protein  42.14 
 
 
281 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1620  hypothetical protein  41.99 
 
 
281 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1382  hypothetical protein  42.14 
 
 
281 aa  232  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1584  hypothetical protein  41.99 
 
 
281 aa  229  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.487764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1341  hypothetical protein  41.28 
 
 
281 aa  228  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1340  hypothetical protein  41.28 
 
 
281 aa  228  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.462218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1551  hypothetical protein  41.28 
 
 
281 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199195 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3831  hypothetical protein  41.07 
 
 
281 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000400731 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1368  hypothetical protein  41.64 
 
 
281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1479  hypothetical protein  41.64 
 
 
281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3062  protein of unknown function DUF72  40.97 
 
 
286 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1183  hypothetical protein  39.36 
 
 
281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000897763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2914  protein of unknown function DUF72  38.54 
 
 
282 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0508  hypothetical protein  37.54 
 
 
282 aa  209  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0920  hypothetical protein  38.25 
 
 
282 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0939  hypothetical protein  38.25 
 
 
282 aa  202  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1873  protein of unknown function DUF72  36.59 
 
 
293 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5842  protein of unknown function DUF72  29.43 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.852032  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0235  hypothetical protein  35.16 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2045  hypothetical protein  27.81 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.148398  normal  0.484103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5493  hypothetical protein  30.38 
 
 
321 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.0343585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  31.54 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2197  protein of unknown function DUF72  28.96 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00260465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6611  protein of unknown function DUF72  29.11 
 
 
297 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3896  hypothetical protein  26.85 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2030  protein of unknown function DUF72  27.36 
 
 
318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273114 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4589  hypothetical protein  27.7 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135422  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1160  hypothetical protein  35.04 
 
 
261 aa  110  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1295  hypothetical protein  35.04 
 
 
261 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  31.25 
 
 
286 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2992  hypothetical protein  30.98 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0078078  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1271  protein of unknown function DUF72  29.89 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000066434  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1898  hypothetical protein  28.62 
 
 
274 aa  96.7  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.652332  normal  0.220603 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1385  hypothetical protein  29.89 
 
 
287 aa  92.8  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  27.61 
 
 
387 aa  88.2  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0421  protein of unknown function DUF72  27.8 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.738835  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0310  hypothetical protein  27.24 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000867171  normal  0.131792 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0315  protein of unknown function DUF72  27.42 
 
 
266 aa  86.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0458  protein of unknown function DUF72  30.74 
 
 
301 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4140  hypothetical protein  30.74 
 
 
296 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950206  hitchhiker  0.001504 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0459  protein of unknown function DUF72  30.74 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0430  hypothetical protein  29.51 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2229  hypothetical protein  27.87 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  29.13 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32511  predicted protein  30.06 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0583738  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1936  hypothetical protein  27.94 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  27 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  30.72 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  25 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  27.89 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  24.19 
 
 
242 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  25.72 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  28.03 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  24.9 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  25.79 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  25.45 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  24.63 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  24.9 
 
 
234 aa  67  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  25.09 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  25.82 
 
 
242 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2976  protein of unknown function DUF72  27.31 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.206183 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  25.72 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1134  hypothetical protein  25.5 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.324615 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  29.05 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  31.64 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  27.13 
 
 
249 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  26.09 
 
 
242 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  24.29 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  24.72 
 
 
279 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  26.12 
 
 
242 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  26.34 
 
 
254 aa  63.5  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  24.91 
 
 
254 aa  63.5  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  26.36 
 
 
249 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  29.38 
 
 
249 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  24.47 
 
 
293 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  25.84 
 
 
241 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  25.1 
 
 
244 aa  62.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0720  hypothetical protein  28.63 
 
 
255 aa  62.4  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  31.62 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  30 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  24.72 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0778  hypothetical protein  27.8 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  26.46 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  27.57 
 
 
259 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0504287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  24.72 
 
 
244 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  24.72 
 
 
244 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  25.32 
 
 
244 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2017  hypothetical protein  25.9 
 
 
231 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  24.08 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  23.24 
 
 
241 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  25.73 
 
 
243 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  25.86 
 
 
256 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1512  hypothetical protein  31.58 
 
 
289 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0131  hypothetical protein  25.63 
 
 
240 aa  59.7  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.333529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  26.74 
 
 
249 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  22.88 
 
 
236 aa  58.9  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  28.42 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  29.47 
 
 
244 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  24.59 
 
 
245 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>