208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2030 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2030  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
318 aa  658    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2197  protein of unknown function DUF72  91.86 
 
 
295 aa  564  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00260465  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3896  hypothetical protein  37.11 
 
 
298 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5493  hypothetical protein  39.8 
 
 
321 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.0343585 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4589  hypothetical protein  36.27 
 
 
300 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135422  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2045  hypothetical protein  35.86 
 
 
306 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.148398  normal  0.484103 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5842  protein of unknown function DUF72  35.17 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.852032  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3062  protein of unknown function DUF72  33.11 
 
 
286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0508  hypothetical protein  30.64 
 
 
282 aa  155  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2914  protein of unknown function DUF72  32.32 
 
 
282 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1873  protein of unknown function DUF72  32.88 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1514  hypothetical protein  32.13 
 
 
281 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0920  hypothetical protein  33.21 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0939  hypothetical protein  33.21 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1183  hypothetical protein  31.41 
 
 
281 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000897763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1341  hypothetical protein  31.41 
 
 
281 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1340  hypothetical protein  31.41 
 
 
281 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.462218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3831  hypothetical protein  31.77 
 
 
281 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000400731 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1551  hypothetical protein  31.41 
 
 
281 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199195 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1584  hypothetical protein  31.41 
 
 
281 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.487764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1620  hypothetical protein  31.05 
 
 
281 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1368  hypothetical protein  31.05 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1479  hypothetical protein  31.05 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6611  protein of unknown function DUF72  32.87 
 
 
297 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1382  hypothetical protein  31.41 
 
 
281 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  34.93 
 
 
286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1295  hypothetical protein  32.08 
 
 
261 aa  126  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1160  hypothetical protein  32.08 
 
 
261 aa  126  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32511  predicted protein  34.16 
 
 
288 aa  123  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0583738  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  31.99 
 
 
251 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1271  protein of unknown function DUF72  33.46 
 
 
284 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000066434  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0209  hypothetical protein  27.36 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1898  hypothetical protein  30.1 
 
 
274 aa  112  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.652332  normal  0.220603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  29.66 
 
 
280 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0235  hypothetical protein  28.47 
 
 
271 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2992  hypothetical protein  29.19 
 
 
272 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0078078  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0421  protein of unknown function DUF72  24.66 
 
 
267 aa  99  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.738835  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0315  protein of unknown function DUF72  26.8 
 
 
266 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  30 
 
 
245 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  27.8 
 
 
387 aa  97.1  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  26.96 
 
 
241 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4140  hypothetical protein  30.84 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950206  hitchhiker  0.001504 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  27.21 
 
 
247 aa  94  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0778  hypothetical protein  26.21 
 
 
250 aa  90.9  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  29.83 
 
 
243 aa  90.1  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0430  hypothetical protein  28.66 
 
 
298 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0458  protein of unknown function DUF72  28.34 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0459  protein of unknown function DUF72  28.34 
 
 
300 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  28.29 
 
 
256 aa  87.4  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  24.15 
 
 
246 aa  85.9  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  27.36 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1385  hypothetical protein  29.53 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  30.24 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  27.93 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  27.37 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  27.87 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  29.19 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2229  hypothetical protein  25.94 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  26.78 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  26.78 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  26.78 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  27.78 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  25.76 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  27.8 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  26.01 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  26.19 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  24.41 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1936  hypothetical protein  24.92 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  27.49 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  26.12 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  31.16 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  27.84 
 
 
249 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  28.02 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0310  hypothetical protein  24.75 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000867171  normal  0.131792 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  25.26 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  30.53 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  27.18 
 
 
249 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  27.52 
 
 
249 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  25.09 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  25.34 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0720  hypothetical protein  24.57 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  25.9 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  25.46 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  26.53 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  26.47 
 
 
244 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  27.12 
 
 
247 aa  67  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  28.15 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  27.05 
 
 
290 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  26 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  28.76 
 
 
251 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  25.45 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  27.53 
 
 
254 aa  64.7  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0131  hypothetical protein  26.2 
 
 
240 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.333529  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1134  hypothetical protein  24.79 
 
 
231 aa  64.7  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.324615 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  28.86 
 
 
271 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  27.45 
 
 
318 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  25.87 
 
 
293 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  27.76 
 
 
254 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0353  hypothetical protein  25.86 
 
 
259 aa  62.8  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0504287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>