177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3896 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3896  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4589  hypothetical protein  66.21 
 
 
300 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135422  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2045  hypothetical protein  60.26 
 
 
306 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.148398  normal  0.484103 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5842  protein of unknown function DUF72  60 
 
 
306 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.852032  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5493  hypothetical protein  43.45 
 
 
321 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.0343585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2197  protein of unknown function DUF72  39.31 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00260465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2030  protein of unknown function DUF72  37.11 
 
 
318 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6611  protein of unknown function DUF72  37.89 
 
 
297 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1341  hypothetical protein  32.58 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1340  hypothetical protein  32.58 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.462218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1551  hypothetical protein  32.58 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1620  hypothetical protein  32.95 
 
 
281 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1584  hypothetical protein  32.58 
 
 
281 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.487764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1368  hypothetical protein  32.2 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1479  hypothetical protein  32.2 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1514  hypothetical protein  31.7 
 
 
281 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0508  hypothetical protein  29.49 
 
 
282 aa  151  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3831  hypothetical protein  29.45 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000400731 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1183  hypothetical protein  28.67 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000897763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2914  protein of unknown function DUF72  30.87 
 
 
282 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3062  protein of unknown function DUF72  31.21 
 
 
286 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0920  hypothetical protein  28.86 
 
 
282 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0939  hypothetical protein  28.86 
 
 
282 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1382  hypothetical protein  29.17 
 
 
281 aa  139  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1873  protein of unknown function DUF72  30.54 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32511  predicted protein  35.03 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0583738  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1271  protein of unknown function DUF72  34.35 
 
 
284 aa  116  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000066434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  29.21 
 
 
286 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0209  hypothetical protein  26.85 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1385  hypothetical protein  31.89 
 
 
287 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  27.59 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0235  hypothetical protein  27.15 
 
 
271 aa  92.4  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1160  hypothetical protein  26.87 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1295  hypothetical protein  26.87 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2992  hypothetical protein  27.57 
 
 
272 aa  89  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0078078  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  27.91 
 
 
251 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0421  protein of unknown function DUF72  23.45 
 
 
267 aa  82  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.738835  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2017  hypothetical protein  28.62 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1898  hypothetical protein  25.35 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.652332  normal  0.220603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0315  protein of unknown function DUF72  24.33 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  23.81 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  25.26 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  24.91 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  25.18 
 
 
244 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  27.48 
 
 
247 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  29.14 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0458  protein of unknown function DUF72  28.81 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  27.68 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  25.68 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  24.82 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0778  hypothetical protein  24.57 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4140  hypothetical protein  30.87 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950206  hitchhiker  0.001504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  26.77 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0459  protein of unknown function DUF72  28.48 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  27.4 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0430  hypothetical protein  28.15 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  23.66 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  26.37 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  24.1 
 
 
240 aa  67  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  24.14 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  25.51 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  26.85 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  26.37 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  26.37 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  26.62 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1859  hypothetical protein  25.59 
 
 
231 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.868685  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  25.43 
 
 
245 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  25.43 
 
 
245 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  26.44 
 
 
242 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0310  hypothetical protein  23.03 
 
 
279 aa  62.4  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000867171  normal  0.131792 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  26.69 
 
 
249 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  25.68 
 
 
256 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  27.1 
 
 
282 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  29.95 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  27.07 
 
 
312 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  26.62 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1263  hypothetical protein  29.78 
 
 
231 aa  60.8  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.593112  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  26.26 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  24.91 
 
 
246 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  22.37 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2229  hypothetical protein  23.47 
 
 
272 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  25.7 
 
 
249 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0720  hypothetical protein  21.4 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  24.24 
 
 
248 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  26.14 
 
 
312 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  22.87 
 
 
246 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  26.77 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0205  hypothetical protein  26.35 
 
 
229 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.967531 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  26 
 
 
325 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  25.76 
 
 
322 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  21.43 
 
 
237 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  22.95 
 
 
251 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1134  hypothetical protein  22.3 
 
 
231 aa  55.8  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.324615 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  25.38 
 
 
336 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1936  hypothetical protein  22.79 
 
 
272 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  23.29 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  23.61 
 
 
321 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  25.4 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  25 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  26.82 
 
 
340 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>