154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5842 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5842  protein of unknown function DUF72  100 
 
 
306 aa  633  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.852032  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2045  hypothetical protein  90.97 
 
 
306 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.148398  normal  0.484103 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3896  hypothetical protein  60 
 
 
298 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4589  hypothetical protein  57.14 
 
 
300 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135422  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5493  hypothetical protein  41.75 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.0343585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2197  protein of unknown function DUF72  35.52 
 
 
295 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00260465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2030  protein of unknown function DUF72  35.17 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6611  protein of unknown function DUF72  35.33 
 
 
297 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480653  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3831  hypothetical protein  30.27 
 
 
281 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000400731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1514  hypothetical protein  30.27 
 
 
281 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0920  hypothetical protein  31 
 
 
282 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0939  hypothetical protein  31 
 
 
282 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3062  protein of unknown function DUF72  31.77 
 
 
286 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0508  hypothetical protein  29.9 
 
 
282 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1620  hypothetical protein  29.59 
 
 
281 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2914  protein of unknown function DUF72  31.1 
 
 
282 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1584  hypothetical protein  29.59 
 
 
281 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.487764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1183  hypothetical protein  28.62 
 
 
281 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000897763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1368  hypothetical protein  28.91 
 
 
281 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1479  hypothetical protein  28.91 
 
 
281 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1341  hypothetical protein  28.91 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1340  hypothetical protein  28.91 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.462218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1551  hypothetical protein  28.91 
 
 
281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1382  hypothetical protein  28.14 
 
 
281 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0969636  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1873  protein of unknown function DUF72  31.44 
 
 
293 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0209  hypothetical protein  29.43 
 
 
282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32511  predicted protein  35.96 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0583738  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  30.64 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1271  protein of unknown function DUF72  32.83 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000066434  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  28.38 
 
 
280 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0235  hypothetical protein  31.15 
 
 
271 aa  106  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1385  hypothetical protein  31.6 
 
 
287 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1160  hypothetical protein  27.24 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1295  hypothetical protein  27.24 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0430  hypothetical protein  33 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0459  protein of unknown function DUF72  32.67 
 
 
300 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0458  protein of unknown function DUF72  32.67 
 
 
301 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4140  hypothetical protein  32.91 
 
 
296 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950206  hitchhiker  0.001504 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  23.84 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1898  hypothetical protein  26.09 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.652332  normal  0.220603 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2992  hypothetical protein  26.45 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0078078  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1936  hypothetical protein  27.27 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2229  hypothetical protein  26.94 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0315  protein of unknown function DUF72  26.45 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  27.12 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0421  protein of unknown function DUF72  25.25 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.738835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  26.85 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  26.05 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  25.74 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2244  hypothetical protein  30.16 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0119465 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2017  hypothetical protein  26.8 
 
 
231 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  24.92 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  22.46 
 
 
240 aa  64.7  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  25.82 
 
 
242 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0778  hypothetical protein  22.07 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1263  hypothetical protein  29.12 
 
 
231 aa  61.2  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.593112  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0131  hypothetical protein  25.42 
 
 
240 aa  60.5  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.333529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  24.92 
 
 
241 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0310  hypothetical protein  23.17 
 
 
279 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000867171  normal  0.131792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  26.3 
 
 
256 aa  59.7  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  27.67 
 
 
271 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0720  hypothetical protein  23.51 
 
 
255 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  25.35 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  26.53 
 
 
245 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  26.53 
 
 
245 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  24.74 
 
 
293 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  37.5 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  24.51 
 
 
252 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  20.21 
 
 
242 aa  56.2  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  25.2 
 
 
299 aa  56.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  26.98 
 
 
293 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  26.94 
 
 
241 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1134  hypothetical protein  20.98 
 
 
231 aa  56.2  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.324615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  25.08 
 
 
242 aa  55.8  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  24 
 
 
244 aa  55.8  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2976  protein of unknown function DUF72  28.11 
 
 
237 aa  55.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.206183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4434  protein of unknown function DUF72  25.81 
 
 
256 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.581377 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3238  hypothetical protein  28.37 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  26.54 
 
 
242 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  24.03 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  27.13 
 
 
218 aa  54.3  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  23.26 
 
 
261 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  26 
 
 
246 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  22.64 
 
 
246 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  35.9 
 
 
244 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  35.44 
 
 
325 aa  52.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  28.14 
 
 
249 aa  52.8  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  35.9 
 
 
244 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1859  hypothetical protein  27.22 
 
 
231 aa  52  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.868685  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  35.9 
 
 
244 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0205  hypothetical protein  29.81 
 
 
229 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.967531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  24.75 
 
 
247 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2024  hypothetical protein  24.88 
 
 
290 aa  50.4  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.838821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1402  hypothetical protein  32.39 
 
 
293 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299884  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  22.01 
 
 
291 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  37.93 
 
 
264 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  24.83 
 
 
249 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  33.75 
 
 
265 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  28.18 
 
 
251 aa  50.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  26.98 
 
 
282 aa  50.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>