227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0778 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0778  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0720  hypothetical protein  47.64 
 
 
255 aa  225  4e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1295  hypothetical protein  40.47 
 
 
261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1160  hypothetical protein  40.47 
 
 
261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0500427  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  35.11 
 
 
280 aa  158  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  31.54 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0315  protein of unknown function DUF72  31.3 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2992  hypothetical protein  30.92 
 
 
272 aa  125  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0078078  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0235  hypothetical protein  30.35 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  35.74 
 
 
240 aa  119  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0430  hypothetical protein  32.03 
 
 
298 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1936  hypothetical protein  30.12 
 
 
272 aa  116  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0459  protein of unknown function DUF72  31.54 
 
 
300 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0458  protein of unknown function DUF72  31.78 
 
 
301 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2229  hypothetical protein  29.73 
 
 
272 aa  113  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1898  hypothetical protein  31.01 
 
 
274 aa  113  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.652332  normal  0.220603 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0310  hypothetical protein  28.31 
 
 
279 aa  113  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000867171  normal  0.131792 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0421  protein of unknown function DUF72  34.39 
 
 
267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.738835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4140  hypothetical protein  32.22 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950206  hitchhiker  0.001504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  31.37 
 
 
243 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  30.52 
 
 
248 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  30.83 
 
 
240 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  32.03 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 
247 aa  99  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  32.41 
 
 
237 aa  97.8  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  32.13 
 
 
236 aa  96.3  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  30.62 
 
 
242 aa  95.9  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  28.69 
 
 
241 aa  95.5  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  28.8 
 
 
242 aa  94.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  29.53 
 
 
241 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  31.92 
 
 
387 aa  93.2  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  26.4 
 
 
293 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  30.52 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  30.52 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2197  protein of unknown function DUF72  26.21 
 
 
295 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00260465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2030  protein of unknown function DUF72  26.21 
 
 
318 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000273114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  28.4 
 
 
242 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  28.46 
 
 
242 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  29.76 
 
 
241 aa  89  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  29.48 
 
 
244 aa  89  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0418  hypothetical protein  31.3 
 
 
217 aa  88.6  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.443516  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  30 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2914  protein of unknown function DUF72  30.5 
 
 
282 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  26.38 
 
 
254 aa  85.9  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  27.95 
 
 
246 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  27.34 
 
 
249 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  25.68 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  25.68 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  25.68 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  28.91 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  26.03 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  27.6 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  32.9 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  27.6 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5493  hypothetical protein  22.55 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.0343585 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  30.56 
 
 
256 aa  79  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  27.24 
 
 
256 aa  79  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0205  hypothetical protein  28.63 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.967531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  27.78 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0508  hypothetical protein  27.53 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3062  protein of unknown function DUF72  28.36 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  26.83 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0920  hypothetical protein  26.55 
 
 
282 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.106512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0939  hypothetical protein  26.55 
 
 
282 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  27.17 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1859  hypothetical protein  28.94 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.868685  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2017  hypothetical protein  27.95 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  27.2 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  25.6 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  26.86 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4589  hypothetical protein  24.05 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135422  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  29.86 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1263  hypothetical protein  26.81 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.593112  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  27.27 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1385  hypothetical protein  26.34 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  31.03 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  26.1 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  30.99 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3896  hypothetical protein  24.57 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1873  protein of unknown function DUF72  25.74 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  28.8 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  29.86 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  31.69 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  25.49 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  26.05 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  31.69 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  26.12 
 
 
218 aa  68.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  25.62 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1134  hypothetical protein  27.63 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.324615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2862  hypothetical protein  31.97 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  32.62 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  24.11 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1271  protein of unknown function DUF72  24.1 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000066434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  32.03 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  24.07 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  32.79 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3084  hypothetical protein  28.77 
 
 
293 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0630619 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  29.73 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0131  hypothetical protein  26.29 
 
 
240 aa  63.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.333529  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>