More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2324 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  43.03 
 
 
1038 aa  737    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  73.11 
 
 
1028 aa  1511    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  42.31 
 
 
1057 aa  707    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  100 
 
 
1095 aa  2211    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  41.47 
 
 
1165 aa  714    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  52.79 
 
 
1201 aa  1028    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  42.9 
 
 
1044 aa  711    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  58.2 
 
 
724 aa  778    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  52.79 
 
 
1201 aa  1028    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  38.63 
 
 
1058 aa  630  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  37.49 
 
 
1046 aa  623  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  38.06 
 
 
1049 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  37.7 
 
 
1031 aa  607  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  37.83 
 
 
1045 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4787  DEAD-like helicases-like protein  76.45 
 
 
338 aa  500  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111321  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  31.76 
 
 
1082 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  31.65 
 
 
1177 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  29.79 
 
 
840 aa  253  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  27.09 
 
 
945 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  28.34 
 
 
954 aa  218  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  30.73 
 
 
969 aa  207  8e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28.92 
 
 
988 aa  207  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  31.5 
 
 
971 aa  203  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  32.48 
 
 
919 aa  202  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  26.41 
 
 
1138 aa  201  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.39 
 
 
835 aa  201  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.39 
 
 
1144 aa  200  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  32.72 
 
 
1094 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  27.59 
 
 
952 aa  197  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  30.4 
 
 
933 aa  196  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  27.59 
 
 
952 aa  195  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  27.59 
 
 
952 aa  195  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  29.36 
 
 
1170 aa  192  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  32.51 
 
 
1167 aa  191  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  32.54 
 
 
1194 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  30.19 
 
 
941 aa  190  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  28.44 
 
 
1136 aa  190  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  29.23 
 
 
969 aa  190  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  30.19 
 
 
941 aa  190  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  29.04 
 
 
1145 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  31.44 
 
 
1167 aa  190  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  26.85 
 
 
952 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  28.55 
 
 
966 aa  188  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  30.49 
 
 
1167 aa  187  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  30.96 
 
 
1172 aa  186  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  28.48 
 
 
962 aa  186  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  29.41 
 
 
1172 aa  186  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  29.48 
 
 
972 aa  184  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  27.75 
 
 
973 aa  185  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  29.53 
 
 
1170 aa  184  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  30.07 
 
 
801 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  29.87 
 
 
1137 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  29.98 
 
 
1169 aa  181  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  29.82 
 
 
1116 aa  179  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  31.02 
 
 
829 aa  179  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  29.76 
 
 
1170 aa  178  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  28.47 
 
 
937 aa  178  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  29.75 
 
 
1169 aa  178  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.7 
 
 
960 aa  177  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.98 
 
 
952 aa  175  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  28.62 
 
 
1062 aa  175  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  29.7 
 
 
1168 aa  173  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  29.77 
 
 
1170 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  30.34 
 
 
1160 aa  171  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  28.15 
 
 
964 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  29.83 
 
 
964 aa  168  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  28.94 
 
 
921 aa  167  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  27.49 
 
 
923 aa  167  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  26.83 
 
 
877 aa  166  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29 
 
 
805 aa  166  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  29.52 
 
 
1131 aa  163  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  29.67 
 
 
953 aa  162  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  30.69 
 
 
1160 aa  161  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  27.24 
 
 
947 aa  161  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  29.32 
 
 
915 aa  160  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  29.32 
 
 
916 aa  160  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  27.8 
 
 
968 aa  159  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  28.17 
 
 
963 aa  159  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  29.32 
 
 
915 aa  159  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  28.09 
 
 
1069 aa  158  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  28.09 
 
 
1069 aa  158  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27.1 
 
 
894 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  29.37 
 
 
919 aa  157  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  27.2 
 
 
937 aa  156  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  30.17 
 
 
949 aa  156  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  27.66 
 
 
969 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  27.87 
 
 
963 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  26.95 
 
 
975 aa  154  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  27.32 
 
 
900 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  28.47 
 
 
955 aa  153  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  29.05 
 
 
922 aa  152  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  26.08 
 
 
949 aa  151  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  27.29 
 
 
949 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  27.89 
 
 
933 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  24.49 
 
 
966 aa  149  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  29.56 
 
 
925 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  27.31 
 
 
958 aa  145  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  25.68 
 
 
669 aa  144  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  27.2 
 
 
958 aa  144  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  26.43 
 
 
942 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>