101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1482 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  100 
 
 		 302 aa  598  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  73.26 
 
 		 297 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  61.4 
 
 		 284 aa  325  5e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  56.54 
 
 		 351 aa  307  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  61.81 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  55.72 
 
 		 299 aa  297  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  59.53 
 
 		 295 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  56.92 
 
 		 333 aa  296  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  61.39 
 
 		 294 aa  296  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  56.98 
 
 		 266 aa  288  7e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  56.25 
 
 		 280 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  56.42 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  56.43 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  56.03 
 
 		 273 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  53.87 
 
 		 297 aa  276  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  52.13 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  53.36 
 
 		 267 aa  269  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  57.14 
 
 		 334 aa  266  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  53.7 
 
 		 303 aa  265  7e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  54.23 
 
 		 291 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  54.51 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  54.55 
 
 		 277 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  54.55 
 
 		 277 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  54.55 
 
 		 277 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  50.69 
 
 		 313 aa  262  4.999999999999999e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  52.92 
 
 		 304 aa  258  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  49.82 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  51.87 
 
 		 278 aa  249  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  49.8 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  49.42 
 
 		 298 aa  235  6e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  37.55 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  28.79 
 
 		 1019 aa  93.6  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  29.28 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  25.74 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  26.01 
 
 		 615 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  31.23 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  29.35 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  28.19 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  22.01 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  32.03 
 
 		 1052 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  25.99 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  27.04 
 
 		 1016 aa  67  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  26.1 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  25.1 
 
 		 543 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  26.79 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  25.36 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  26.81 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  27.78 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.26 
 
 		 1124 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  28.85 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  31.6 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  28.57 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  26.05 
 
 		 379 aa  55.8  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  29.5 
 
 		 1038 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  27.21 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  25.9 
 
 		 263 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  25.32 
 
 		 379 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  30.05 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  27.88 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  25.27 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  25.12 
 
 		 788 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  27.76 
 
 		 1038 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  24.43 
 
 		 783 aa  50.4  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  27.2 
 
 		 387 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  24.88 
 
 		 788 aa  50.1  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  25.12 
 
 		 788 aa  49.7  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  27.2 
 
 		 387 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  27.2 
 
 		 387 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  27.2 
 
 		 387 aa  49.3  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  25.13 
 
 		 781 aa  48.5  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  27.47 
 
 		 865 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  31.03 
 
 		 993 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  30.98 
 
 		 1101 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  22.81 
 
 		 781 aa  48.5  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0282  hypothetical protein  24.53 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  24.49 
 
 		 1048 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.07 
 
 		 1094 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1052 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  23.14 
 
 		 779 aa  47.4  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  29.95 
 
 		 1052 aa  47.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  32.8 
 
 		 1051 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  36.84 
 
 		 1164 aa  47  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  32.8 
 
 		 1051 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  28.86 
 
 		 1349 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  25 
 
 		 780 aa  47  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1737  phage NTP-binding protein  20.69 
 
 		 530 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  32.8 
 
 		 1051 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  32.31 
 
 		 991 aa  46.2  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  28.66 
 
 		 1106 aa  46.2  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  25 
 
 		 960 aa  45.8  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1061 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.41 
 
 		 1042 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  30.77 
 
 		 988 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  34.84 
 
 		 913 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  30.18 
 
 		 1059 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  29.25 
 
 		 1052 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  23.14 
 
 		 263 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  23.73 
 
 		 1041 aa  42.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.66 
 
 		 1049 aa  42.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  31.3 
 
 		 1055 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>