More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0933 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0933  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 561 aa  1137    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2624  extracellular solute-binding protein family 5  44.3 
 
 		 547 aa  463  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1678  extracellular solute-binding protein family 5  42.26 
 
 		 553 aa  408  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1485  extracellular solute-binding protein family 5  43.47 
 
 		 579 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2512  extracellular solute-binding protein family 5  37.86 
 
 		 565 aa  355  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.012201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20180  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.84 
 
 		 551 aa  292  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1397  extracellular solute-binding protein family 5  34.29 
 
 		 567 aa  291  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.75572 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 		 531 aa  272  1e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2397  extracellular solute-binding protein  32.83 
 
 		 597 aa  259  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3400  extracellular solute-binding protein family 5  35.02 
 
 		 567 aa  249  9e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.110204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  31.63 
 
 		 627 aa  242  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1398  extracellular solute-binding protein family 5  32.35 
 
 		 562 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 		 551 aa  237  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  31.35 
 
 		 548 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  31.15 
 
 		 548 aa  236  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  29.55 
 
 		 557 aa  225  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  32.46 
 
 		 568 aa  224  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.39 
 
 		 552 aa  223  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34930  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.59 
 
 		 563 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.953561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0398  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 559 aa  215  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.333674  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7456  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.65 
 
 		 563 aa  213  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03423  hypothetical protein  29.33 
 
 		 560 aa  211  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002586  (GlcNAc)2 ABC transporter: substrate-binding protein  29.92 
 
 		 560 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.51 
 
 		 556 aa  208  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0171  extracellular solute-binding protein family 5  28.52 
 
 		 540 aa  207  6e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01310  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.09 
 
 		 564 aa  206  9e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.860675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1178  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 		 576 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5668  extracellular solute-binding protein family 5  28.88 
 
 		 557 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6188  extracellular solute-binding protein family 5  31.12 
 
 		 560 aa  201  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215725  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0545  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  27.93 
 
 		 545 aa  199  7.999999999999999e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000683285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0910  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport systems, periplasmic components  32.66 
 
 		 572 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0403  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 		 565 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.189174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2728  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 568 aa  184  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.768674  normal  0.998981 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2510  extracellular solute-binding protein family 5  26.47 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1900  extracellular solute-binding protein family 5  27.12 
 
 		 569 aa  179  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0147571  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1553  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 559 aa  163  7e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.208561  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1592  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 560 aa  162  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.382923  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0914  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 604 aa  157  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0892  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 604 aa  156  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.02 
 
 		 572 aa  154  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0262  extracellular solute-binding protein family 5  29.57 
 
 		 587 aa  154  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.578222  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3512  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 		 580 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1545  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 557 aa  150  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.2137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1595  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 557 aa  149  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0133917  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0214  extracellular solute-binding protein family 5  26.94 
 
 		 609 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000434403  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17760  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.64 
 
 		 609 aa  144  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.321388  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0488  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 576 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 510 aa  126  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2053  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 579 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0131056  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1676  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 636 aa  124  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2501  extracellular solute-binding protein family 5  25.34 
 
 		 608 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3011  ABC transporter related  25.48 
 
 		 577 aa  118  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.631119  normal  0.383065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  25.48 
 
 		 562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.38 
 
 		 589 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 512 aa  114  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  24.16 
 
 		 645 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 524 aa  109  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  23.96 
 
 		 537 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.82 
 
 		 588 aa  108  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.97 
 
 		 587 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6804  extracellular solute-binding protein family 5  23.13 
 
 		 634 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.910845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  30 
 
 		 523 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.98 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0337  extracellular solute-binding protein family 5  27.02 
 
 		 521 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0239  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0886528  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.3 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  26.36 
 
 		 596 aa  100  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4667  extracellular solute-binding protein family 5  26 
 
 		 587 aa  100  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.16 
 
 		 542 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  23.45 
 
 		 540 aa  96.7  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.55 
 
 		 527 aa  96.3  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  25.62 
 
 		 522 aa  96.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0853  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 625 aa  95.5  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.157029  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0876  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 625 aa  95.1  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0197038  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 565 aa  94.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4406  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 		 541 aa  93.2  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.37 
 
 		 542 aa  93.2  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0734  extracellular solute-binding protein family 5  23.87 
 
 		 594 aa  92.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.780369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1414  extracellular solute-binding protein family 5  29.75 
 
 		 636 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 		 503 aa  92.4  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 516 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 522 aa  91.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.3 
 
 		 543 aa  90.9  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  25.47 
 
 		 631 aa  90.9  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3658  extracellular solute-binding protein family 5  30.89 
 
 		 366 aa  90.9  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 543 aa  90.5  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.83 
 
 		 542 aa  90.1  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.19 
 
 		 538 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 508 aa  89.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.19 
 
 		 516 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  24.26 
 
 		 505 aa  88.2  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  25.87 
 
 		 509 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1244  extracellular solute-binding protein family 5  27.88 
 
 		 588 aa  88.2  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.863592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5701  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  22.39 
 
 		 607 aa  87.8  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2082  ABC transporter, binding protein component  30.03 
 
 		 605 aa  87.4  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645423 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3985  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 499 aa  87.4  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  24.18 
 
 		 533 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 512 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  27.01 
 
 		 565 aa  86.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4354  extracellular solute-binding protein family 5  25.98 
 
 		 497 aa  86.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>