101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0260 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 		 723 aa  1407    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  50.21 
 
 		 715 aa  611  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  49.58 
 
 		 730 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  48.18 
 
 		 733 aa  557  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  44.19 
 
 		 740 aa  552  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  44.99 
 
 		 727 aa  548  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  47.22 
 
 		 724 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  43.62 
 
 		 718 aa  543  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  46.59 
 
 		 704 aa  538  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  46.47 
 
 		 721 aa  530  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  43.33 
 
 		 735 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  43.03 
 
 		 724 aa  528  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  45.3 
 
 		 726 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  45.95 
 
 		 747 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  44.95 
 
 		 707 aa  511  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  46.03 
 
 		 747 aa  501  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  40.85 
 
 		 714 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  40.3 
 
 		 714 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  40.13 
 
 		 768 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  40.91 
 
 		 709 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  40.34 
 
 		 709 aa  464  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  36.9 
 
 		 708 aa  462  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  36.9 
 
 		 708 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  36.9 
 
 		 708 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.68 
 
 		 718 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  38.21 
 
 		 707 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  39.09 
 
 		 708 aa  456  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  39.09 
 
 		 708 aa  456  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.21 
 
 		 700 aa  448  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  37.05 
 
 		 722 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  36.78 
 
 		 733 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  38.03 
 
 		 723 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  38.03 
 
 		 736 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  39.12 
 
 		 699 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  38.26 
 
 		 701 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  38.67 
 
 		 728 aa  362  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.01 
 
 		 688 aa  342  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  34.51 
 
 		 719 aa  335  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  29.44 
 
 		 743 aa  300  4e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  30.07 
 
 		 729 aa  300  5e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  31.12 
 
 		 739 aa  299  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  33.21 
 
 		 722 aa  293  7e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  31.21 
 
 		 729 aa  293  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  32.07 
 
 		 726 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  29.87 
 
 		 729 aa  287  5e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.75 
 
 		 729 aa  284  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  30.37 
 
 		 729 aa  281  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.07 
 
 		 733 aa  278  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  32.44 
 
 		 740 aa  273  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  26.46 
 
 		 734 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  26.46 
 
 		 730 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  35.92 
 
 		 701 aa  272  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  35.62 
 
 		 699 aa  270  5e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  31.32 
 
 		 750 aa  256  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  32.15 
 
 		 774 aa  249  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  35.04 
 
 		 734 aa  242  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  31.61 
 
 		 726 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  32.32 
 
 		 713 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  30.41 
 
 		 818 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  28.08 
 
 		 713 aa  231  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  33.69 
 
 		 716 aa  226  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  29.66 
 
 		 730 aa  213  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  27.16 
 
 		 726 aa  212  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  27.46 
 
 		 727 aa  189  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  36.3 
 
 		 530 aa  150  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  29.56 
 
 		 684 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.03 
 
 		 683 aa  120  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  25.42 
 
 		 706 aa  106  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  25.37 
 
 		 732 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  25.97 
 
 		 657 aa  99.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.8 
 
 		 674 aa  91.3  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  26.9 
 
 		 675 aa  90.9  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  27.06 
 
 		 679 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  31.67 
 
 		 669 aa  79.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  26.4 
 
 		 723 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  19.8 
 
 		 700 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0664  glycoside hydrolase, clan GH-D  27.93 
 
 		 684 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  26.42 
 
 		 824 aa  64.7  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  27.23 
 
 		 578 aa  61.6  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  27.1 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  31.15 
 
 		 589 aa  60.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  24.86 
 
 		 562 aa  59.7  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  29.31 
 
 		 1020 aa  58.9  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  24.83 
 
 		 737 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2828  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.41 
 
 		 510 aa  55.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.816401  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  28.68 
 
 		 555 aa  54.7  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01910  alpha-galactosidase  26.32 
 
 		 505 aa  53.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  29.17 
 
 		 541 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0375  hypothetical protein  31.09 
 
 		 700 aa  51.2  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  22.46 
 
 		 694 aa  50.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  29.29 
 
 		 782 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  23.93 
 
 		 579 aa  48.5  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  23.31 
 
 		 579 aa  48.5  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  24.43 
 
 		 589 aa  47.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1560  Alpha-galactosidase-like protein  24.16 
 
 		 552 aa  47.8  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.59787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1626  alpha-galactosidase-like protein  24.16 
 
 		 552 aa  47.4  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  29.25 
 
 		 411 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  26.86 
 
 		 441 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  33.7 
 
 		 547 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  31.82 
 
 		 399 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>