More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2539 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  100 
 
 		 567 aa  1157    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  36.48 
 
 		 566 aa  348  1e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  33.11 
 
 		 485 aa  282  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  33.26 
 
 		 485 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  33.49 
 
 		 485 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  32.33 
 
 		 485 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  32.56 
 
 		 485 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  32.56 
 
 		 485 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  32.56 
 
 		 485 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  31.86 
 
 		 485 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  32.33 
 
 		 485 aa  267  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  31.86 
 
 		 485 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  27.1 
 
 		 591 aa  265  1e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  32.09 
 
 		 485 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  33.81 
 
 		 526 aa  234  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  29.64 
 
 		 603 aa  230  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  31.88 
 
 		 519 aa  226  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  35.34 
 
 		 513 aa  225  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  31.83 
 
 		 517 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  32.35 
 
 		 529 aa  210  7e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  30.7 
 
 		 497 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  31.93 
 
 		 803 aa  203  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  29.53 
 
 		 523 aa  203  8e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  33.73 
 
 		 547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  31.28 
 
 		 544 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  30.15 
 
 		 503 aa  194  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  29.3 
 
 		 499 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  34.41 
 
 		 620 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  28.33 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  33.17 
 
 		 551 aa  176  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  31.28 
 
 		 530 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  31.46 
 
 		 531 aa  170  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  29.24 
 
 		 533 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  30.23 
 
 		 531 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  30.1 
 
 		 533 aa  163  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  27.52 
 
 		 526 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  31.48 
 
 		 466 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  31.92 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  31.92 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  29.36 
 
 		 455 aa  162  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  31.46 
 
 		 531 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  28.88 
 
 		 519 aa  161  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  31.47 
 
 		 655 aa  160  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  33.98 
 
 		 533 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  33.98 
 
 		 533 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  33.98 
 
 		 533 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  28.66 
 
 		 519 aa  156  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  31.98 
 
 		 550 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  31.1 
 
 		 447 aa  154  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  30.9 
 
 		 601 aa  151  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  31.94 
 
 		 566 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  30.17 
 
 		 562 aa  150  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  26.84 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  31.25 
 
 		 485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  32.54 
 
 		 539 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  27.85 
 
 		 380 aa  146  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  31.26 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  30.57 
 
 		 822 aa  143  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  27.81 
 
 		 453 aa  143  9.999999999999999e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  27.04 
 
 		 544 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  27.14 
 
 		 536 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  32.71 
 
 		 461 aa  140  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  31.53 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  30.75 
 
 		 530 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  24.78 
 
 		 426 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  30.73 
 
 		 595 aa  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.4 
 
 		 477 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  26.41 
 
 		 389 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  25.71 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  31.85 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  24.69 
 
 		 385 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  30.4 
 
 		 681 aa  130  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  30.61 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  30.28 
 
 		 445 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.67 
 
 		 505 aa  128  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  29.41 
 
 		 444 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  32.01 
 
 		 463 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  28.3 
 
 		 377 aa  126  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  32.02 
 
 		 356 aa  126  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  28.53 
 
 		 588 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  28.89 
 
 		 559 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.01 
 
 		 442 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  28.05 
 
 		 537 aa  123  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  25.15 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  25.15 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  31.63 
 
 		 464 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.46 
 
 		 484 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.53 
 
 		 362 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  31.93 
 
 		 497 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.11 
 
 		 543 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.11 
 
 		 543 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  32.34 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.34 
 
 		 480 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  29.6 
 
 		 445 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  25.48 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.09 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3874  beta-lactamase  25.6 
 
 		 359 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  25.34 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  25.34 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  25.62 
 
 		 463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>