More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0659 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0659  outer membrane protein, OmpA family  100 
 
 		 307 aa  637    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05164  hypothetical protein  56.07 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  26.75 
 
 		 466 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  27.19 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  26.43 
 
 		 457 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  25.86 
 
 		 468 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  36.19 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  36.19 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2839  OmpA/MotB domain protein  34.09 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  25.44 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  25.43 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  25.85 
 
 		 459 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  30.28 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  25.32 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  41.24 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 218 aa  67  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  37.74 
 
 		 214 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 218 aa  67  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  37 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  39.25 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.18 
 
 		 172 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  33.58 
 
 		 669 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  35.45 
 
 		 637 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  33.65 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  37.74 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  28.49 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  28.76 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  29.08 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  29.08 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  31.48 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  28.24 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  28.24 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  35.24 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.85 
 
 		 607 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2218  OmpA/MotB domain-containing protein  31.25 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.906577  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  34.02 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  37.27 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  27.48 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  32.14 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  28.24 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  35.05 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  37.11 
 
 		 217 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  32.04 
 
 		 189 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  32.14 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  33.04 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  26.97 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1203  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.232705 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  35.71 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  37.35 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  37.11 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0727  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 178 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  28.37 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0749  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.61 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000395754  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1732  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.14 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.110246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  35.05 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  27.66 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1911  OmpA domain-containing protein  37.25 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0225  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.92 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000120265  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  28.24 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  27.74 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  34 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  26.24 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  33.58 
 
 		 1755 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  27.65 
 
 		 1793 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  33.61 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0318  OmpA/MotB domain-containing protein  29.71 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0137068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  32.71 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1463  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.373103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  32.81 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0277  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0615  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  38.46 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0124381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  31.4 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  30.58 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  31.43 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  35.24 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  35.24 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  32.69 
 
 		 352 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  34.15 
 
 		 544 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  33.98 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2160  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.92 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000805861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3971  peptidoglycan-associated lipoprotein  35 
 
 		 166 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  35 
 
 		 167 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  33.03 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1747  OmpA domain-containing protein  33.65 
 
 		 178 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000284949  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3148  OmpA/MotB domain-containing protein  28.21 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1743  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.65 
 
 		 178 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000604821  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  33.93 
 
 		 215 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  29.38 
 
 		 173 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2537  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.65 
 
 		 178 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000399266  hitchhiker  0.000124284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>