235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02794 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  90.29 
 
 
412 aa  773    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  852    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  62.07 
 
 
436 aa  524  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  62.78 
 
 
421 aa  520  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  60.41 
 
 
396 aa  510  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  60.86 
 
 
414 aa  509  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  53.53 
 
 
413 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  53.96 
 
 
447 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  53.09 
 
 
451 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  52.72 
 
 
451 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  53.77 
 
 
446 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  50.84 
 
 
453 aa  418  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  52.48 
 
 
451 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  52.97 
 
 
451 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  52.14 
 
 
447 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  52.39 
 
 
447 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  50.97 
 
 
441 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  49.5 
 
 
459 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  51.33 
 
 
475 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  50 
 
 
469 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  50.25 
 
 
471 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  48.62 
 
 
445 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  48.02 
 
 
460 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  48.76 
 
 
441 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  48.18 
 
 
437 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  48.18 
 
 
437 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  48.76 
 
 
437 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  45.65 
 
 
439 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  47.42 
 
 
445 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  46.23 
 
 
434 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  46.84 
 
 
440 aa  359  5e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  47.09 
 
 
437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  45.56 
 
 
490 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  45.52 
 
 
499 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23420  protein kinase  45.32 
 
 
438 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  45.71 
 
 
440 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  42.72 
 
 
446 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  44.2 
 
 
436 aa  336  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  43.42 
 
 
444 aa  326  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  42.29 
 
 
464 aa  320  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  42.93 
 
 
444 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  43.96 
 
 
439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  42.93 
 
 
473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  42.89 
 
 
450 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  42.61 
 
 
432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  40.44 
 
 
437 aa  292  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  38.65 
 
 
484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47992  predicted protein  36.27 
 
 
432 aa  232  9e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  29.91 
 
 
1263 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  31.34 
 
 
482 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  33.01 
 
 
1041 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  33.16 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  31.84 
 
 
892 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.33 
 
 
1015 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.84 
 
 
1107 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  34.2 
 
 
508 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  37.27 
 
 
937 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.97 
 
 
863 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  31.87 
 
 
867 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  36.65 
 
 
937 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  34.94 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  30.14 
 
 
886 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  29.9 
 
 
354 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  31.46 
 
 
242 aa  72  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  31.44 
 
 
761 aa  70.5  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  32.52 
 
 
1749 aa  69.3  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  30.3 
 
 
713 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  28.82 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  24.56 
 
 
925 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  27.91 
 
 
204 aa  63.5  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.14 
 
 
305 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  31.74 
 
 
384 aa  61.2  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  31.77 
 
 
757 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  29.95 
 
 
329 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  26.94 
 
 
476 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  28.95 
 
 
467 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  27.98 
 
 
586 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06044  Protein kinase NPKA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J0Q5]  23.95 
 
 
467 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4351  hypothetical protein  26.7 
 
 
580 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.426597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  28.9 
 
 
1494 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  32.68 
 
 
2324 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90135  cell division control protein  26.06 
 
 
310 aa  57.4  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0872901  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  31.69 
 
 
1498 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.748697 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  31.91 
 
 
972 aa  57  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  29.68 
 
 
448 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04030  cell division cycle 2, putative  29.33 
 
 
411 aa  56.6  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.464356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  30.56 
 
 
1498 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04290  protein kinase, putative  24.28 
 
 
573 aa  56.6  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0054946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0999  serine/threonine kinase protein  30 
 
 
896 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2062  serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 
617 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54126  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 
468 aa  55.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.216144  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77550  ser/thr protein kinase  24.28 
 
 
410 aa  55.1  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.373676  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0408  hypothetical protein  30.43 
 
 
293 aa  55.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  30.83 
 
 
558 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  29.06 
 
 
802 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  28.87 
 
 
1496 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  25.42 
 
 
641 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3601  serine-threonine kinase Stk1  27.91 
 
 
329 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  30.71 
 
 
1395 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3560  Protein of unknown function DUF1963  27.42 
 
 
791 aa  53.1  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00826775  normal  0.0597462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>