More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2786 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  100 
 
 		 243 aa  483  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  46.31 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  40.78 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 216 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 222 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  38.85 
 
 		 179 aa  101  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 173 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7119  putative transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00221905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 199 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  37.81 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  54.26 
 
 		 182 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 201 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 202 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  37.66 
 
 		 218 aa  86.3  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 266 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 216 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5248  putative transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 227 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 174 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  35.33 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
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NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 176 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  54.05 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  40.13 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  66.07 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2057  putative transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  34.04 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 188 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  36.52 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  34.38 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3935  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00534901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  51.19 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  51.39 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  59.68 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2371  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164383  normal  0.061065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 208 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_21000  transcriptional regulator, tetR family  40.74 
 
 		 199 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  0.198219 
 
 
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NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  52.94 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0877  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
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