More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2113 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2110  extracellular solute-binding protein  48.65 
 
 		 735 aa  680    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1805  extracellular solute-binding protein family 5  57.95 
 
 		 659 aa  791    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2113  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 729 aa  1507    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1530  extracellular solute-binding protein family 5  59.36 
 
 		 656 aa  800    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  57.73 
 
 		 765 aa  907    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2424  extracellular solute-binding protein  51.51 
 
 		 728 aa  679    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.935396 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1927  extracellular solute-binding protein family 5  59.78 
 
 		 735 aa  893    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2808  extracellular solute-binding protein  51.43 
 
 		 727 aa  676    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3050  extracellular solute-binding protein  49.17 
 
 		 757 aa  679    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0190244  normal  0.13375 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1703  extracellular solute-binding protein family 5  33.02 
 
 		 638 aa  293  8e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1687  extracellular solute-binding protein  32.04 
 
 		 664 aa  286  8e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.789812  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0293  extracellular solute-binding protein family 5  31.45 
 
 		 640 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.835457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1677  extracellular solute-binding protein  32.07 
 
 		 655 aa  275  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0500  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 		 643 aa  265  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.464453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0608  extracellular solute-binding protein  31.16 
 
 		 658 aa  260  8e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0360846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0510  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 		 655 aa  259  9e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00108617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0622  extracellular solute-binding protein  31.16 
 
 		 658 aa  259  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.16709  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0868  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 		 657 aa  259  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0890  extracellular solute-binding protein  32.96 
 
 		 657 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5178  extracellular solute-binding protein family 5  29.69 
 
 		 645 aa  240  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758105  normal  0.361664 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5447  extracellular solute-binding protein family 5  30.5 
 
 		 645 aa  236  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390622 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5555  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 642 aa  231  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140103  normal  0.0740019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2454  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 		 682 aa  230  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39331 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5515  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  34.91 
 
 		 633 aa  227  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171495  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5255  extracellular solute-binding protein family 5  29.97 
 
 		 651 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.313455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3683  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 639 aa  220  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.378617  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7124  extracellular solute-binding protein family 5  30.13 
 
 		 635 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104115  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5971  extracellular solute-binding protein family 5  29.21 
 
 		 635 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.989436  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5700  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.06 
 
 		 638 aa  197  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0714934  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3373  extracellular solute-binding protein family 5  29.01 
 
 		 641 aa  198  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0279191  normal  0.223354 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4483  twin-arginine translocation pathway signal  26.65 
 
 		 686 aa  194  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6476  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 643 aa  187  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.864629 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4593  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 633 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.996188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7228  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 664 aa  184  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0309461  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3160  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  26.68 
 
 		 679 aa  180  8e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3931  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.61 
 
 		 626 aa  179  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14300  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.49 
 
 		 671 aa  177  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.860083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0595  extracellular solute-binding protein family 5  30.2 
 
 		 645 aa  169  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2830  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 655 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108136  normal  0.289716 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4140  extracellular solute-binding protein  31.26 
 
 		 693 aa  154  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0860796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6877  extracellular solute-binding protein family 5  28.86 
 
 		 695 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0668794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5907  extracellular solute-binding protein family 5  30.09 
 
 		 696 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  26.1 
 
 		 580 aa  139  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5120  ABC transporter substrate binding protein (alpha-galactoside)  29.66 
 
 		 695 aa  137  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0244807  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2595  extracellular solute-binding protein family 5  27.93 
 
 		 589 aa  136  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1660  extracellular solute-binding protein family 5  29.46 
 
 		 589 aa  132  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.299882  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1386  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 578 aa  128  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  26.86 
 
 		 573 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 591 aa  118  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2510  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 584 aa  115  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.543923  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1564  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 578 aa  114  7.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00697686  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1810  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 595 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  25.89 
 
 		 584 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0406  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 579 aa  107  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  26.04 
 
 		 607 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1663  extracellular solute-binding protein family 5  24.28 
 
 		 578 aa  106  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397427  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0390  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 579 aa  105  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  25.78 
 
 		 607 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1172  family 1 extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 594 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1832  extracellular solute-binding protein family 5  25.81 
 
 		 587 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1169  oligopeptide-binding protein of oligopeptide ABC transporter  23.36 
 
 		 587 aa  96.3  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1143  extracellular solute-binding protein family 5  23.82 
 
 		 577 aa  95.9  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0057674  normal  0.283725 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2749  extracellular solute-binding protein family 5  24.34 
 
 		 645 aa  93.6  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.655087  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1326  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 587 aa  94  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000186412  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 544 aa  91.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  24.54 
 
 		 540 aa  91.3  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 		 548 aa  90.9  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 		 548 aa  90.5  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.39 
 
 		 539 aa  89.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1182  extracellular solute-binding protein family 5  23.4 
 
 		 581 aa  87  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.76 
 
 		 531 aa  87  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  24.83 
 
 		 537 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  22.89 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 551 aa  85.5  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0631  extracellular solute-binding protein family 5  24.94 
 
 		 631 aa  84  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00116155  normal  0.250691 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1367  extracellular solute-binding protein family 5  22.29 
 
 		 577 aa  84  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0090511  hitchhiker  0.000580883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 544 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 638 aa  82.8  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  26.85 
 
 		 524 aa  82.8  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  25.65 
 
 		 530 aa  82  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  22.35 
 
 		 588 aa  82  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.82 
 
 		 532 aa  82  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.65 
 
 		 534 aa  80.9  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 535 aa  80.5  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 525 aa  80.5  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  24.01 
 
 		 544 aa  79  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.5 
 
 		 532 aa  79  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  25.92 
 
 		 527 aa  79  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0892  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 596 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  23.96 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1815  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 		 535 aa  78.2  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.847688  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 526 aa  78.2  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 530 aa  78.2  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0149  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.66 
 
 		 556 aa  77.8  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  24.61 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  25.36 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 536 aa  77.4  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  23.81 
 
 		 627 aa  77.4  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.95 
 
 		 534 aa  77  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 547 aa  76.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0395598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>