More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2074 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2074  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 353 aa  687    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.104068  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0321  efflux transporter, RND family, MFP subunit  95.73 
 
 		 386 aa  629  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  48.53 
 
 		 364 aa  272  7e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4180  RND family efflux transporter MFP subunit  45.15 
 
 		 366 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.249201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5559  secretion protein HlyD  45.32 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  31.41 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.71 
 
 		 377 aa  169  7e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00317162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.18 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.37 
 
 		 360 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.37 
 
 		 360 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 376 aa  149  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  28.89 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  30.17 
 
 		 379 aa  132  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0549  secretion protein HlyD  31.61 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.54 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  32.11 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.31 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.08 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1234  RND family efflux transporter MFP subunit  26.43 
 
 		 359 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  31.15 
 
 		 370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  30.88 
 
 		 401 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  hitchhiker  0.000000766037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1455  RND family efflux transporter MFP subunit  28.53 
 
 		 345 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  29.64 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0231  RND family efflux transporter MFP subunit  31.18 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0223  RND family efflux transporter MFP subunit  31.18 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3379  RND family efflux transporter MFP subunit  30.3 
 
 		 409 aa  116  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.16 
 
 		 404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2802  secretion protein HlyD  30.88 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.71 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0304  RND family efflux transporter MFP subunit  30.88 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.2 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.23 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  30.06 
 
 		 380 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0505  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.14 
 
 		 349 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  28.29 
 
 		 421 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  27.4 
 
 		 407 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.18 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000306136  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3852  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.49 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3403  HlyD family secretion protein  29.12 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00376035  normal  0.420161 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0207  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000100142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  25.22 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  29.7 
 
 		 404 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.73 
 
 		 380 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 354 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3712  RND family efflux transporter MFP subunit  29 
 
 		 450 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.40893 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.14 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0392  RND family efflux transporter MFP subunit  29.72 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  26.03 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0664  RND family efflux transporter MFP subunit  26.91 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.295272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  27.7 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.51 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.7 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 358 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  25.28 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6009  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.71 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359632  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  26.98 
 
 		 402 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.23 
 
 		 355 aa  107  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3664  RND family efflux transporter MFP subunit  27.27 
 
 		 370 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0878  secretion protein HlyD  28.1 
 
 		 263 aa  106  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0949246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  26.59 
 
 		 364 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2499  RND family efflux transporter MFP subunit  30.61 
 
 		 416 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2827  RND family efflux transporter MFP subunit  30.28 
 
 		 352 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00918161  hitchhiker  0.00100699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  32.53 
 
 		 366 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0583  HlyD family secretion protein  30.18 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  24.64 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  24.93 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3024  secretion protein HlyD  31.49 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.756641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  25.8 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1818  RND family efflux transporter MFP subunit  27.8 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224471  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  27.17 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  30.09 
 
 		 416 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.8 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.8 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.23 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  26.09 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  29.09 
 
 		 404 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2957  secretion protein HlyD  29.62 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0178504  normal  0.933874 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2213  secretion protein HlyD  27.74 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  30.32 
 
 		 422 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0618  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  26.67 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.74 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  25.63 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  23.77 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  26.21 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 		 351 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1877  RND family efflux transporter MFP subunit  29.7 
 
 		 405 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  27.85 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  26.12 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000160707  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  25.36 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.25 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  27.62 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.61 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  30.43 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0906  RND family efflux transporter MFP subunit  27.1 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  27.93 
 
 		 382 aa  99.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000015375  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3936  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.12 
 
 		 365 aa  99.8  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117548 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  30.98 
 
 		 353 aa  99.8  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  24.35 
 
 		 352 aa  99.4  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2792  RND family efflux transporter MFP subunit  26.08 
 
 		 412 aa  99.4  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  28.45 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>