104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1733 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 559 aa  1092    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  57.68 
 
 		 528 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  49.58 
 
 		 524 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  44.83 
 
 		 506 aa  315  9.999999999999999e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  28.18 
 
 		 495 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 		 690 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  28.3 
 
 		 495 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 500 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 		 490 aa  101  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 499 aa  97.8  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  28.4 
 
 		 647 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  26.88 
 
 		 499 aa  94.4  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  25.27 
 
 		 662 aa  93.6  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  28.11 
 
 		 537 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  25.25 
 
 		 499 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  23.8 
 
 		 514 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  25.88 
 
 		 762 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  24.74 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  25.47 
 
 		 508 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  26.14 
 
 		 590 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  23.21 
 
 		 577 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  25.49 
 
 		 587 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25.14 
 
 		 576 aa  64.3  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.72 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.45 
 
 		 462 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 		 972 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.25 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 510 aa  57  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  23.34 
 
 		 509 aa  57  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 		 449 aa  57  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  23.46 
 
 		 507 aa  57  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.53 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 		 448 aa  55.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 493 aa  54.7  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0710  outer membrane protein-like protein  23.89 
 
 		 475 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000105718  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3997  Outer membrane protein-like protein  23.21 
 
 		 486 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000837564 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.38 
 
 		 500 aa  54.7  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  25.27 
 
 		 448 aa  54.7  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.21 
 
 		 483 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  27.17 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  32.16 
 
 		 463 aa  52  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1470 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 471 aa  51.2  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  27.49 
 
 		 447 aa  51.2  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0872  Outer membrane protein-like  25.3 
 
 		 517 aa  50.4  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 525 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  24.35 
 
 		 435 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.89 
 
 		 481 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  24.93 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.21 
 
 		 1496 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.51 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  22.78 
 
 		 493 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  24.47 
 
 		 522 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  20.24 
 
 		 432 aa  49.3  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 458 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.19 
 
 		 497 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 		 487 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1970  integral outer membrane protein TolC, efflux pump component  19.51 
 
 		 487 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000188791  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  25.15 
 
 		 627 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0090  hypothetical protein  25.64 
 
 		 731 aa  48.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.7 
 
 		 437 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  25.98 
 
 		 459 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.63 
 
 		 497 aa  47.8  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  24.16 
 
 		 453 aa  47.8  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.43 
 
 		 478 aa  47.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 565 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  24.86 
 
 		 463 aa  47  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.96 
 
 		 485 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  21.64 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.73 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4027  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.27 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296212  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.43 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  26.69 
 
 		 447 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.55 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.01 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.25 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1064  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  27.22 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  22.95 
 
 		 435 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  22.95 
 
 		 435 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  22.95 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  27.42 
 
 		 495 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  23.64 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0834  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.98 
 
 		 483 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.933668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1000  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 448 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495217  normal  0.0302884 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  23.18 
 
 		 431 aa  44.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  22.34 
 
 		 493 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  26.64 
 
 		 432 aa  44.3  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2692  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 		 469 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.81 
 
 		 428 aa  44.3  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.6 
 
 		 431 aa  44.3  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 442 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.99 
 
 		 467 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 		 419 aa  43.9  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  26 
 
 		 405 aa  43.9  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>