16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1970 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1970  integral outer membrane protein TolC, efflux pump component  100 
 
 		 487 aa  993    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000188791  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0075  putative outer membrane component of multidrug efflux  47.21 
 
 		 501 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0947347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  23.48 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  25 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 647 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 495 aa  53.9  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  23.94 
 
 		 495 aa  53.9  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  23.32 
 
 		 499 aa  48.5  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  19.51 
 
 		 559 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  29.17 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2109  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.46 
 
 		 466 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 587 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 762 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  26.39 
 
 		 528 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  28.65 
 
 		 524 aa  43.9  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>