44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1000 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1000  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 448 aa  905    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495217  normal  0.0302884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3983  outer membrane efflux protein  43.57 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6010  outer membrane efflux protein  34.21 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.750386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0509  outer membrane efflux protein  29.51 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  25.34 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  19.47 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  20.92 
 
 		 462 aa  55.8  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  24.91 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 447 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1638  30S ribosomal protein S12  30.26 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.57 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 535 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  22.85 
 
 		 443 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  28.91 
 
 		 635 aa  50.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 498 aa  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  23.24 
 
 		 455 aa  49.7  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.77 
 
 		 467 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  30.73 
 
 		 506 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  22.26 
 
 		 458 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  21.91 
 
 		 447 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  22.4 
 
 		 437 aa  47  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  18.49 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.09 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3271  outer membrane efflux protein OprA  23.89 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3621  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.21353  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  25.86 
 
 		 972 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6465  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.84 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0283455 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  23.03 
 
 		 528 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5601  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.66 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5965  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.66 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  20.53 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 559 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  27.22 
 
 		 443 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  21.45 
 
 		 421 aa  43.9  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  22.54 
 
 		 448 aa  43.1  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>