70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6010 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6010  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 462 aa  932    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.750386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1000  outer membrane efflux protein  34.21 
 
 		 448 aa  227  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495217  normal  0.0302884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3983  outer membrane efflux protein  31.82 
 
 		 455 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0509  outer membrane efflux protein  30.23 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 972 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  26.53 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  29.21 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  25.85 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  23.67 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  25.18 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  28.86 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  23.69 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.25 
 
 		 522 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  20.51 
 
 		 441 aa  53.9  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 498 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  20.18 
 
 		 446 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  25.37 
 
 		 523 aa  53.5  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 		 471 aa  53.5  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  22.59 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  30.1 
 
 		 471 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  30.1 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  27.51 
 
 		 508 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.42 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  22.29 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  24.09 
 
 		 594 aa  51.2  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 		 535 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 528 aa  50.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  23.71 
 
 		 437 aa  50.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 419 aa  50.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 448 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  25.64 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  26.81 
 
 		 460 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  25.75 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3233  outer membrane efflux protein  25.8 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367218  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  25.75 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  20.91 
 
 		 438 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 		 471 aa  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1537  Outer membrane efflux protein  27.11 
 
 		 445 aa  47.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  26.09 
 
 		 472 aa  47.8  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  20.57 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4169  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.63 
 
 		 470 aa  47  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  21.89 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.2 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.65 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  26.28 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4462  CzcA family heavy metal efflux protein  24.78 
 
 		 1446 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  26 
 
 		 514 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 565 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.46 
 
 		 518 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  21.17 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  27.05 
 
 		 464 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  27.45 
 
 		 513 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  19.2 
 
 		 469 aa  45.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  20.78 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  25.43 
 
 		 731 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  20.14 
 
 		 470 aa  44.3  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  20.65 
 
 		 457 aa  44.3  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  19.76 
 
 		 440 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.47 
 
 		 443 aa  43.9  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  19.4 
 
 		 445 aa  43.9  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2191  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 		 508 aa  43.5  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>